More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1658 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 409 aa  809    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  78.06 
 
 		 391 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  60.56 
 
 		 590 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 		 550 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.57 
 
 		 571 aa  250  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 571 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  34.35 
 
 		 572 aa  176  8e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  34.68 
 
 		 573 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.18 
 
 		 573 aa  172  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.66 
 
 		 566 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  33.08 
 
 		 591 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 567 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  32.07 
 
 		 401 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 568 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 525 aa  156  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  30.61 
 
 		 543 aa  156  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 595 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 544 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  32.23 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  34.86 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  31.73 
 
 		 577 aa  143  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 		 543 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 588 aa  140  3.9999999999999997e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 		 631 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 372 aa  132  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 566 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 592 aa  124  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  29.63 
 
 		 635 aa  125  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 566 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 		 568 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 568 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 568 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 568 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 565 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  32 
 
 		 578 aa  117  5e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 580 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 392 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 		 535 aa  109  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 579 aa  109  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 381 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.03 
 
 		 575 aa  102  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  34.28 
 
 		 573 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  34 
 
 		 536 aa  97.1  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  31.76 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  27.52 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  29.27 
 
 		 484 aa  84  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 345 aa  80.1  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  28.63 
 
 		 673 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 665 aa  77  0.0000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  29.8 
 
 		 547 aa  75.5  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 535 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 618 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5475  histidine kinase  29.13 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.256989  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3834  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 709 aa  68.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.154622  normal  0.0585187 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 		 574 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  25.44 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 		 517 aa  66.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1292  sensory box histidine kinase  29.61 
 
 		 384 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  30.55 
 
 		 795 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 591 aa  64.7  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  24.85 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0971  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.73 
 
 		 567 aa  63.9  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.630053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 779 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.73 
 
 		 552 aa  63.2  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 564 aa  63.2  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2027  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 401 aa  62.4  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109719  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 391 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 508 aa  61.6  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  23.7 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  23.83 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 363 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0693  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 474 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2298  histidine kinase  24.88 
 
 		 1093 aa  60.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  29.12 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0030  ATPase domain-containing protein  24.6 
 
 		 1739 aa  60.1  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0930  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  26.95 
 
 		 567 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000296832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  28.32 
 
 		 515 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3151  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 453 aa  60.1  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 		 449 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1400  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 644 aa  59.3  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.324076  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  25.86 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.52 
 
 		 622 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3495  signal transduction histidine kinase-like protein  26.28 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0736574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 591 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2783  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.01 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 780 aa  58.5  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2636  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.51 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0761488  normal  0.0281081 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.48 
 
 		 370 aa  58.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>