More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1545 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1545  histidine kinase  100 
 
 		 708 aa  1443    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00108525  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1622  response regulator receiver protein  47.57 
 
 		 641 aa  421  1e-116  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.923164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0744  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2918  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 		 658 aa  230  8e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1227  ATP-binding region ATPase domain protein  25.59 
 
 		 787 aa  228  4e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.570195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1567  signal transduction histidine kinase, LytS  26.32 
 
 		 1016 aa  227  6e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0336431  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  24.55 
 
 		 1018 aa  215  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0493  signal transduction histidine kinase, LytS  25.66 
 
 		 1022 aa  205  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000359244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 473 aa  196  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.84 
 
 		 590 aa  177  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 		 604 aa  173  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  35.69 
 
 		 484 aa  170  7e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  169  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  34.85 
 
 		 496 aa  169  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  169  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1842  histidine kinase  35.02 
 
 		 324 aa  167  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.531893  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.41 
 
 		 694 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 484 aa  167  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 597 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  34.9 
 
 		 484 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 		 597 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 581 aa  163  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 		 487 aa  162  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 571 aa  159  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.74 
 
 		 418 aa  157  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 591 aa  157  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2585  methyl-accepting chemotaxis domain/unknown domain-containing protein  26.63 
 
 		 775 aa  156  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000884798  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 585 aa  156  1e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  33.61 
 
 		 487 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 		 367 aa  154  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 484 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 484 aa  153  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 489 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.12 
 
 		 599 aa  153  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 		 723 aa  152  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  35.11 
 
 		 591 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  35.11 
 
 		 591 aa  150  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 457 aa  150  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 		 462 aa  150  9e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 493 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 591 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0996  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 396 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 471 aa  149  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 392 aa  148  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 471 aa  148  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 		 460 aa  148  4.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 591 aa  147  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  34.67 
 
 		 591 aa  147  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 481 aa  147  9e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  32.79 
 
 		 593 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 468 aa  147  9e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  34.67 
 
 		 591 aa  146  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 		 608 aa  147  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 462 aa  146  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 587 aa  145  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 513 aa  145  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3481  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.24 
 
 		 704 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112139 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  34.22 
 
 		 591 aa  145  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  34.22 
 
 		 591 aa  145  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 600 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.98 
 
 		 587 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0710  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 484 aa  144  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 596 aa  144  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 646 aa  144  5e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.98 
 
 		 587 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1695  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 354 aa  144  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 379 aa  144  6e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 458 aa  144  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0495  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 487 aa  144  7e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0640  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 487 aa  144  7e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 592 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 		 451 aa  144  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 332 aa  143  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0247  histidine kinase  36.1 
 
 		 488 aa  143  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.60943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 582 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  34.6 
 
 		 587 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0497  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 484 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 589 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.96 
 
 		 581 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  31.9 
 
 		 589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.29 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0553  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  34.6 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1814  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.98 
 
 		 384 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.863381  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  34.6 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0584  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  34.6 
 
 		 587 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  33.21 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>