More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2844 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
657 aa  1324    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2469  multi-sensor hybrid histidine kinase  65.33 
 
 
655 aa  832    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344805  normal  0.830162 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.77 
 
 
890 aa  325  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1184 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0517  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
997 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.660732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
810 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0533  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
997 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.05 
 
 
846 aa  310  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0793  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
871 aa  309  9e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
869 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  33.99 
 
 
882 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.64 
 
 
860 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
1184 aa  304  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1906  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.9 
 
 
619 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.343997  unclonable  0.0000148298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.39 
 
 
886 aa  300  4e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
869 aa  300  5e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
882 aa  300  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.78 
 
 
1023 aa  300  7e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
886 aa  295  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.63 
 
 
893 aa  293  6e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3567  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 
738 aa  291  3e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.339814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
1023 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.86 
 
 
829 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1175  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.53 
 
 
821 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0725739 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.26 
 
 
841 aa  279  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.75 
 
 
827 aa  277  4e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.82 
 
 
1040 aa  275  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
962 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
914 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 
759 aa  262  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
1102 aa  259  9e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3293  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 
692 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.56 
 
 
1193 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
1113 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.51 
 
 
981 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.32 
 
 
870 aa  253  9.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4547  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.73 
 
 
973 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
1108 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
654 aa  246  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.386835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.26 
 
 
817 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1134 aa  242  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.12 
 
 
1106 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0536  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
531 aa  243  1e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1418 aa  242  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4343  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
759 aa  241  4e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.77937  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0550  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 
540 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0519596 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0463  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
642 aa  240  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.31 
 
 
860 aa  239  1e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.48627  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1801  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
522 aa  237  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0233266 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1337  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 
822 aa  236  8e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.121372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1079 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5814  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.49 
 
 
583 aa  233  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.552615  normal  0.0161436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.88 
 
 
661 aa  232  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
859 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.38 
 
 
1122 aa  229  9e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 
522 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.550886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 
1509 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
559 aa  229  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.500087  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.63 
 
 
916 aa  228  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
853 aa  228  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1007  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 
557 aa  226  7e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.607179  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1555  sensory box histidine kinase/response regulator  31.03 
 
 
1112 aa  226  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0269  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.34 
 
 
885 aa  226  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 
953 aa  225  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1723  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
664 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
897 aa  224  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
721 aa  223  7e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.814379  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0435  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
703 aa  223  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
645 aa  223  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
777 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
983 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
871 aa  221  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4481  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
737 aa  221  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.913087  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 
714 aa  220  6e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.756709  normal  0.201817 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2494  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
663 aa  220  6e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4039  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
1039 aa  220  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1737  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.51 
 
 
720 aa  219  1e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.166788  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1934  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.51 
 
 
720 aa  219  1e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.668168  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1918  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
650 aa  218  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.204421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 
953 aa  219  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
836 aa  216  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0320  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.96 
 
 
838 aa  216  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.72 
 
 
1419 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.53 
 
 
1034 aa  215  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 
819 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000597485  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2375  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 
766 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.352057 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.92 
 
 
803 aa  214  4.9999999999999996e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.2 
 
 
643 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.535539  normal  0.0122943 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3722  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
845 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 
639 aa  213  9e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.42 
 
 
1309 aa  213  9e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0454  multisensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
766 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2408  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.68 
 
 
647 aa  213  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385618  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.79 
 
 
1275 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2107  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 
770 aa  212  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4753  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 
630 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1525  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
872 aa  211  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.40409  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2155  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 
753 aa  210  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1740  multi-sensor hybrid histidine kinase / cell cycle control histidine kinase CckA  30.24 
 
 
866 aa  210  7e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 
1132 aa  209  9e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>