More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1246 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1246  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 508 aa  1043    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  54.13 
 
 		 509 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  31.99 
 
 		 649 aa  190  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  42.36 
 
 		 380 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  44.09 
 
 		 380 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  44.09 
 
 		 380 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  44.09 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  44.09 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  44.09 
 
 		 380 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  44.09 
 
 		 358 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  44.09 
 
 		 380 aa  187  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  44.09 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  43.01 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2467  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 		 481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  26.75 
 
 		 637 aa  163  6e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  28.67 
 
 		 642 aa  160  5e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  27.71 
 
 		 642 aa  156  7e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  25.68 
 
 		 637 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  25.55 
 
 		 853 aa  113  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4433  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 		 370 aa  107  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.9 
 
 		 389 aa  104  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4309  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.22 
 
 		 766 aa  103  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  29.3 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.3 
 
 		 467 aa  100  6e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.83 
 
 		 400 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  29.48 
 
 		 378 aa  97.8  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.27 
 
 		 378 aa  96.7  9e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  29.81 
 
 		 389 aa  95.5  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  30.74 
 
 		 391 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  29.8 
 
 		 708 aa  95.5  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.88 
 
 		 380 aa  95.1  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3285  putative PAS/PAC sensor protein  24.68 
 
 		 516 aa  95.1  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  28.4 
 
 		 1082 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2062  serine phosphatase  29.63 
 
 		 366 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.39738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.66 
 
 		 678 aa  93.6  7e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  30.65 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  30.53 
 
 		 395 aa  92.8  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.93 
 
 		 378 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3390  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.93 
 
 		 867 aa  92.8  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.81451  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0975  putative PAS/PAC sensor protein  24.61 
 
 		 516 aa  92.4  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  29.47 
 
 		 363 aa  92.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  31.2 
 
 		 1087 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  33.33 
 
 		 378 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4615  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  29.44 
 
 		 758 aa  90.5  6e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0613125 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.53 
 
 		 379 aa  90.5  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  21.6 
 
 		 754 aa  90.5  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  23.13 
 
 		 684 aa  90.5  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31 
 
 		 526 aa  90.1  9e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.21 
 
 		 590 aa  90.1  9e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.84 
 
 		 392 aa  90.1  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  22.73 
 
 		 536 aa  89.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0376  hypothetical protein  28.64 
 
 		 760 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.523743  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  31.63 
 
 		 396 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.33 
 
 		 935 aa  88.6  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0032  stage II sporulation E family protein  29.1 
 
 		 365 aa  89  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03720  sensory box GGDEF domain-containing protein  28.64 
 
 		 760 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000164821 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  30.37 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  32.97 
 
 		 497 aa  88.2  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2305  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.2 
 
 		 935 aa  88.6  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0882428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  29.79 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  29.7 
 
 		 391 aa  87.8  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  25.07 
 
 		 409 aa  87.8  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  26.8 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  27.96 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0012  serine phosphatase  28.63 
 
 		 469 aa  87  7e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.407331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1526  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.92 
 
 		 504 aa  87  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  30.47 
 
 		 391 aa  86.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  30.4 
 
 		 1087 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  30.74 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  33.16 
 
 		 422 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  28.24 
 
 		 467 aa  85.9  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  26.91 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  28.06 
 
 		 502 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  28.28 
 
 		 519 aa  85.1  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3006  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.04 
 
 		 1064 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0999  response regulator receiver protein  29.53 
 
 		 452 aa  84.7  0.000000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.766542  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4210  protein serine/threonine phosphatase  28.72 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.379426  normal  0.154823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.63 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.63 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  28.57 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  26.69 
 
 		 394 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0193  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.22 
 
 		 924 aa  84.7  0.000000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0289682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6719  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  29.95 
 
 		 1037 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.556524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  24.86 
 
 		 378 aa  84  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.79 
 
 		 407 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  32.97 
 
 		 753 aa  83.6  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29.23 
 
 		 697 aa  83.6  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  28.23 
 
 		 410 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  31.25 
 
 		 683 aa  83.2  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0278  Serine phosphatase  26.34 
 
 		 463 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0012  serine phosphatase  28.63 
 
 		 470 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.41 
 
 		 572 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1542  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.35 
 
 		 1006 aa  82.4  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101137 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 1711 aa  82  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1516  putative PAS/PAC sensor protein  25.66 
 
 		 545 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00955123  decreased coverage  0.00000000236227 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  24.91 
 
 		 451 aa  81.6  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2891  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 477 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.772324 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2227  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.5 
 
 		 1275 aa  81.6  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0368  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor  26.32 
 
 		 1375 aa  81.3  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.147732  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  31.76 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>