More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0812 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0812  Stage II sporulation E family protein  100 
 
 		 422 aa  865    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  38.04 
 
 		 396 aa  194  3e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.09 
 
 		 392 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35.25 
 
 		 378 aa  174  2.9999999999999996e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  36.36 
 
 		 378 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  32.82 
 
 		 380 aa  167  4e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  38.34 
 
 		 389 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  35.5 
 
 		 378 aa  162  9e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3260  diguanylate cyclase with GAF sensor  49.71 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.29 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.92 
 
 		 680 aa  160  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2176  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.43 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4722  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.58 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  37.29 
 
 		 379 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3672  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.88 
 
 		 681 aa  156  6e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497248  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2011  diguanylate cyclase  48.68 
 
 		 321 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0759816  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2356  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.29 
 
 		 319 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.10775 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1699  fused adenylate cyclase and hybrid sensor diguanylate cyclase and response regulator  44.85 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.481687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2140  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.24 
 
 		 318 aa  153  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.480431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  46.59 
 
 		 694 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0918  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.1 
 
 		 323 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2886  diguanylate cyclase with GAF sensor  48.43 
 
 		 326 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.322967 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4126  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.09 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.859123  normal  0.0985842 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4238  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.09 
 
 		 348 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3263  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  42.7 
 
 		 669 aa  151  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3444  diguanylate cyclase  48.41 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0894  diguanylate cyclase  47.47 
 
 		 323 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.499341  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0928  diguanylate cyclase  48.1 
 
 		 323 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1643  diguanylate cyclase with GAF sensor  47.09 
 
 		 506 aa  149  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.65001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  35 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3138  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.71 
 
 		 345 aa  146  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3037  GGDEF domain-containing protein  43.75 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.78 
 
 		 878 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  36.84 
 
 		 441 aa  144  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1949  diguanylate cyclase, putative  48.12 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1466  GAF domain-containing protein  41.57 
 
 		 249 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0393  putative GAF sensor protein  31.55 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667086  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0405  serine phosphatase  31.55 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0414  putative GAF sensor protein  31.55 
 
 		 413 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.479373  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  35.89 
 
 		 431 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3108  diguanylate cyclase with GAF sensor  45.88 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0864  diguanylate cyclase with GAF sensor  46.75 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15351  GAF domain-containing protein  40.11 
 
 		 238 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.581628  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17911  GAF domain-containing protein  39.69 
 
 		 253 aa  141  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0934  hypothetical protein  39.69 
 
 		 253 aa  141  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3329  PAS:GGDEF  42.68 
 
 		 732 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00020555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3096  diguanylate phosphodiesterase with GAF sensor  45.4 
 
 		 595 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665544  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15721  GAF domain-containing protein  40.11 
 
 		 249 aa  140  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0792  hypothetical protein  40.98 
 
 		 240 aa  140  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.327217  normal  0.0268431 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15571  GAF domain-containing protein  40.11 
 
 		 249 aa  140  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0414818  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1392  putative sensory transduction histidine kinase  40.93 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 		 399 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3759  GGDEF domain-containing protein  44.79 
 
 		 324 aa  138  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02131  GGDEF domain-containing PAS signal transduction protein  38.5 
 
 		 794 aa  138  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3217  diguanylate cyclase  41.3 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.201545  normal  0.0694192 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0066  GGDEF domain-containing protein  46.3 
 
 		 743 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.928161  normal  0.0154172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 929 aa  138  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5586  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 		 390 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  45.34 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2985  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 		 321 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.369432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2505  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  41.3 
 
 		 345 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.430442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.57 
 
 		 1550 aa  137  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03205  histidine kinase response regulator hybrid protein  47.06 
 
 		 542 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.132161  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2463  hypothetical protein  46.32 
 
 		 341 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.162594  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3085  diguanylate cyclase  45.86 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0833  diguanylate cyclase with GAF sensor  44.3 
 
 		 322 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2420  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.79 
 
 		 624 aa  134  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.533876  normal  0.201744 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.41 
 
 		 743 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.766687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2253  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  36.65 
 
 		 780 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2479  diguanylate cyclase with GAF sensor  39.39 
 
 		 531 aa  133  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.838154  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.33 
 
 		 526 aa  132  9e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1559  hypothetical protein  39.77 
 
 		 245 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.33 
 
 		 1224 aa  131  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3496  hypothetical protein  40.84 
 
 		 497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.676733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0877  putative phytochrome sensor protein  51.85 
 
 		 603 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0810026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0961  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.46 
 
 		 465 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0655  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.95 
 
 		 864 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  43.67 
 
 		 1423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2826  hypothetical protein  41.25 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5599  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6199  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  40.36 
 
 		 740 aa  127  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08061  hypothetical protein  37.24 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7959  signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 		 416 aa  126  7e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1118  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.14 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2310  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  32.91 
 
 		 400 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3060  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  40.72 
 
 		 442 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4535  putative GAF sensor protein  41.61 
 
 		 251 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  34.12 
 
 		 754 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0785  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.8 
 
 		 367 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0800  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  38.41 
 
 		 781 aa  124  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1367  putative phytochrome sensor protein  49.34 
 
 		 607 aa  124  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.829477  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2118  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.42 
 
 		 1125 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.187673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 1309 aa  123  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1782  PAS sensor protein  43.42 
 
 		 1125 aa  123  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.522243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1946  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.87 
 
 		 722 aa  123  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.146362  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1229  diguanylate cyclase  42.26 
 
 		 356 aa  122  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.586021  normal  0.0822929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3195  sensor histidine kinase  44.78 
 
 		 438 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211172  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4345  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 		 890 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  42.95 
 
 		 1191 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02127  sensor histidine kinase  38.38 
 
 		 398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>