More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0252 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  100 
 
 		 663 aa  1338    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  98.34 
 
 		 663 aa  1313    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  40.86 
 
 		 679 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  36.84 
 
 		 661 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  35.2 
 
 		 666 aa  389  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1487  diguanylate cyclase  32.24 
 
 		 587 aa  213  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0988426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4125  diguanylate cyclase  32.83 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.13437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  38.27 
 
 		 614 aa  207  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  37.2 
 
 		 616 aa  207  7e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  30.85 
 
 		 572 aa  206  9e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2273  diguanylate cyclase  35.93 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0206  diguanylate cyclase  29.84 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0661328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  32.47 
 
 		 397 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 		 410 aa  168  2.9999999999999998e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  39.1 
 
 		 413 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  33.09 
 
 		 403 aa  164  5.0000000000000005e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  37.64 
 
 		 410 aa  164  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  34.55 
 
 		 557 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  36.74 
 
 		 415 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  31.7 
 
 		 556 aa  155  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  31.44 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  34.75 
 
 		 414 aa  151  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  35.46 
 
 		 604 aa  150  9e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 		 411 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  32.16 
 
 		 459 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  31.66 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3680  stage II sporulation E family protein  26.89 
 
 		 786 aa  103  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0105855 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  26.18 
 
 		 705 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.93 
 
 		 706 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03914  IcfG protein  26.32 
 
 		 643 aa  98.6  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  27.37 
 
 		 708 aa  96.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2643  protein serine/threonine phosphatase  26.7 
 
 		 785 aa  96.3  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  30.21 
 
 		 543 aa  94.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2304  protein serine/threonine phosphatase  26.22 
 
 		 786 aa  94  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  27.87 
 
 		 723 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  26.9 
 
 		 645 aa  90.9  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  26.24 
 
 		 649 aa  88.2  4e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  23.23 
 
 		 645 aa  88.2  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  27.61 
 
 		 660 aa  85.1  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.77 
 
 		 648 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0857  serine phosphatase  26.57 
 
 		 643 aa  84.3  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00025918  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  24.13 
 
 		 644 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  25.64 
 
 		 705 aa  82.4  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 705 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  28.01 
 
 		 716 aa  82  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0596  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.89 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.270432 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.19 
 
 		 640 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.825575 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  22.8 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  27.25 
 
 		 657 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000409011 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.18 
 
 		 645 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.32 
 
 		 645 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  25.99 
 
 		 385 aa  78.6  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  26.07 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 699 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.13 
 
 		 384 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 		 792 aa  73.9  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  30.22 
 
 		 633 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  29.86 
 
 		 376 aa  73.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.43 
 
 		 645 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1439  methyl-accepting chemotaxis protein  19.01 
 
 		 641 aa  70.5  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336763  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.4 
 
 		 507 aa  70.5  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  26.38 
 
 		 404 aa  69.7  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3308  diguanylate cyclase  24.82 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  23.73 
 
 		 559 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  23.9 
 
 		 642 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  27.33 
 
 		 683 aa  68.9  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  25.2 
 
 		 663 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  29.72 
 
 		 649 aa  68.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.36 
 
 		 643 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3858  anti-sigma-factor antagonist  34.85 
 
 		 357 aa  67.4  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2388  sensory box histidine kinase  29.51 
 
 		 733 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2449  GGDEF domain-containing protein  24.57 
 
 		 498 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  25.82 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  23.64 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.5 
 
 		 563 aa  65.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  26.73 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  25.84 
 
 		 910 aa  65.1  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  22.97 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  30.5 
 
 		 846 aa  64.7  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  22.97 
 
 		 817 aa  64.7  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  23.4 
 
 		 967 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  23.4 
 
 		 967 aa  64.3  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  28.02 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  27.05 
 
 		 566 aa  63.9  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.59 
 
 		 1480 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0353  putative CheA signal transduction histidine kinases  26.37 
 
 		 1023 aa  62.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4260  sensor histidine kinase/response regulator  28.36 
 
 		 669 aa  62  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  21.39 
 
 		 373 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1935  anti-sigma-factor antagonist  40.66 
 
 		 421 aa  62  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.4 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  24.21 
 
 		 536 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2574  protein serine/threonine phosphatase  27.09 
 
 		 496 aa  61.6  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0552  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  22.95 
 
 		 648 aa  61.2  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283806  decreased coverage  0.00439756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  25.91 
 
 		 715 aa  61.2  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3723  HAMP domain-containing protein  23.38 
 
 		 628 aa  61.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21159  normal  0.539738 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  25.08 
 
 		 840 aa  60.8  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  25.36 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  26.32 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>