168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5997 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5997  protein serine/threonine phosphatase  100 
 
 		 774 aa  1526    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  30.76 
 
 		 715 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  27.3 
 
 		 556 aa  82  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5042  protein serine/threonine phosphatase  26.87 
 
 		 502 aa  76.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.384072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  28.11 
 
 		 563 aa  75.1  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  28.25 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.26 
 
 		 748 aa  70.9  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  25.91 
 
 		 1083 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  25.13 
 
 		 584 aa  68.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  26.94 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  23.93 
 
 		 1100 aa  65.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4375  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.21 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.33 
 
 		 602 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  24.25 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25.84 
 
 		 1480 aa  64.7  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  17.75 
 
 		 559 aa  64.3  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  23.42 
 
 		 1079 aa  63.9  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  26.34 
 
 		 1087 aa  63.9  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  23.01 
 
 		 705 aa  63.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  19.35 
 
 		 590 aa  63.5  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1521  protein serine/threonine phosphatase  25.35 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.834142 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.9 
 
 		 393 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.9 
 
 		 393 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0844  stage II sporulation E family protein  24.63 
 
 		 454 aa  61.6  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0011  serine phosphatase  26.53 
 
 		 447 aa  60.8  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.893308  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  27.34 
 
 		 1087 aa  60.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  23.51 
 
 		 1082 aa  60.1  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3110  putative PAS/PAC sensor protein  29.19 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.63551  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  25.72 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.22 
 
 		 606 aa  60.1  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  20.6 
 
 		 840 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0838  putative PAS/PAC sensor protein  26.25 
 
 		 754 aa  59.7  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7237  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  31.68 
 
 		 579 aa  59.3  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.51 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0928709  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  25.52 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1417  protein serine/threonine phosphatase  27.23 
 
 		 400 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.291528  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3068  serine phosphatase  23.32 
 
 		 612 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.266208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1652  stage II sporulation E family protein  25.91 
 
 		 687 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0030302 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  22.85 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.33 
 
 		 413 aa  57.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2066  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.12 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1752  protein phosphatase 2C-like  29.71 
 
 		 591 aa  57.4  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  27.2 
 
 		 846 aa  57  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1989  putative PAS/PAC sensor protein  37.5 
 
 		 722 aa  57  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.965966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3234  serine phosphatase  23.08 
 
 		 631 aa  57.4  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4817  response regulator receiver modulated serine phosphatase with GAF sensor  23.92 
 
 		 553 aa  57  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5014  serine phosphatase  24.46 
 
 		 459 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  25.51 
 
 		 447 aa  57.4  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13090  Stage II sporulation protein E (SpoIIE)  26.79 
 
 		 576 aa  57  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0195  sigma factor sigB regulation protein  19.38 
 
 		 683 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  28.16 
 
 		 637 aa  55.8  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  23.64 
 
 		 754 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1860  protein serine/threonine phosphatase  24.04 
 
 		 396 aa  55.1  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1793  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  21.28 
 
 		 486 aa  55.1  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  26.82 
 
 		 671 aa  55.1  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  17.77 
 
 		 404 aa  54.7  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0093  stage II sporulation E family protein  20.9 
 
 		 464 aa  54.7  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  22.48 
 
 		 648 aa  54.7  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  26.11 
 
 		 536 aa  54.3  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  22.73 
 
 		 378 aa  54.3  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  20.42 
 
 		 670 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  20.42 
 
 		 667 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00101  protein phosphatase 2C domain-containing protein  24.49 
 
 		 423 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.43645  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  27.93 
 
 		 455 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2687  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.91 
 
 		 480 aa  53.9  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  23.47 
 
 		 404 aa  52.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0772  serine phosphatase  27.9 
 
 		 502 aa  53.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  27 
 
 		 683 aa  52.8  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0631  sigma factor regulatory protein, putative  17.22 
 
 		 708 aa  52.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1606  putative PAS/PAC sensor protein  30.18 
 
 		 693 aa  52.4  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.132491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  23.57 
 
 		 410 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25.84 
 
 		 519 aa  52.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.09 
 
 		 496 aa  52  0.00004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0709  protein serine/threonine phosphatase  23.64 
 
 		 716 aa  52  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0250  PAS containing protein phosphatase 2C-like  25.16 
 
 		 753 aa  51.6  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.337993  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2573  protein serine/threonine phosphatase  25 
 
 		 439 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.783308  hitchhiker  0.000338162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  22.39 
 
 		 708 aa  52  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2401  protein serine/threonine phosphatase  25.47 
 
 		 376 aa  51.6  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151226 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2915  protein serine/threonine phosphatase  23.9 
 
 		 521 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0468  protein serine/threonine phosphatase  22.42 
 
 		 445 aa  51.6  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1739  PAS/protein phosphatase 2C-like  29.38 
 
 		 817 aa  51.2  0.00007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  25.45 
 
 		 649 aa  51.2  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2473  serine phosphatase  22.4 
 
 		 462 aa  51.2  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000579544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  26.96 
 
 		 535 aa  51.2  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3329  ANTAR domain protein with unknown sensor  31.29 
 
 		 830 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  25.48 
 
 		 684 aa  50.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0109  putative PAS/PAC sensor protein  28.57 
 
 		 776 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310164  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3797  putative GAF sensor protein  33.66 
 
 		 828 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818563 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0453  stage II sporulation E family protein  21.72 
 
 		 445 aa  50.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.315946  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  28.21 
 
 		 487 aa  50.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  22.88 
 
 		 521 aa  50.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2187  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  23.96 
 
 		 497 aa  50.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0672  RsbU-like serine phosphatase, regulator of sigma subunit  26.74 
 
 		 254 aa  49.3  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000100052  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3495  serine phosphatase  26.26 
 
 		 262 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0721  serine phosphatase  24.44 
 
 		 885 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1151  serine phosphatase  32.21 
 
 		 713 aa  50.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  25.5 
 
 		 644 aa  50.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  26.09 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  28.77 
 
 		 395 aa  49.7  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6225  putative PAS/PAC sensor protein  36.27 
 
 		 713 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>