More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0083 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  100 
 
 		 559 aa  1138    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2279  diguanylate cyclase  32.36 
 
 		 467 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  35.88 
 
 		 373 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28640  cyclic di-GMP signal transduction protein  36.19 
 
 		 834 aa  147  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 378 aa  147  7.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1622  PAS  27.39 
 
 		 802 aa  133  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.2135  normal  0.458803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2837  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 716 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0516  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.21 
 
 		 980 aa  128  3e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.579103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0505  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.92 
 
 		 952 aa  126  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2588  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.57 
 
 		 710 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0652312  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  28.48 
 
 		 443 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1027  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.4 
 
 		 842 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0664928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  29.21 
 
 		 467 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.79 
 
 		 526 aa  118  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  31.34 
 
 		 531 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3229  histidine kinase  32.43 
 
 		 610 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0740386  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 1044 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.7 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.646626  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1325  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.63 
 
 		 843 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000657328  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0875  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 628 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0713  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.75 
 
 		 384 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  29.59 
 
 		 409 aa  108  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2468  stage II sporulation E family protein  28.68 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.49 
 
 		 1166 aa  106  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  32.45 
 
 		 360 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2578  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.45 
 
 		 702 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.194283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  28.25 
 
 		 708 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3051  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 947 aa  105  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2045  putative GAF sensor protein  26.77 
 
 		 1079 aa  105  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0456906  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  27.63 
 
 		 767 aa  104  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4186  histidine kinase  28.88 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1749  putative PAS/PAC sensor protein  26.02 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000958902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  25.84 
 
 		 817 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  25.84 
 
 		 817 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2642  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.848189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  29.34 
 
 		 451 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.86 
 
 		 496 aa  100  6e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3533  putative PAS/PAC sensor protein  26.84 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0975  protein serine/threonine phosphatase  29.43 
 
 		 642 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  26.42 
 
 		 451 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.18 
 
 		 384 aa  100  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  26.44 
 
 		 397 aa  100  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  26.6 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 665 aa  100  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  27.53 
 
 		 412 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  26.05 
 
 		 443 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1230  serine phosphatase  26.09 
 
 		 1100 aa  97.8  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.081901 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1199  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.42 
 
 		 962 aa  97.8  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2659  serine phosphatase  27.62 
 
 		 1083 aa  97.4  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.623664  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  28.92 
 
 		 683 aa  97.1  7e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  25.38 
 
 		 967 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  26.86 
 
 		 644 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.38 
 
 		 967 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  26.57 
 
 		 637 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  27.18 
 
 		 570 aa  95.5  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1347  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 638 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.679676  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0288  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.44 
 
 		 572 aa  95.1  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.33 
 
 		 563 aa  95.1  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1539  protein serine/threonine phosphatase  27.86 
 
 		 363 aa  94.4  5e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3932  response regulator receiver modulated serine phosphatase  28.74 
 
 		 388 aa  94.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.380742 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0699  protein serine/threonine phosphatase  27.49 
 
 		 379 aa  94  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  24.63 
 
 		 649 aa  94  7e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  24.81 
 
 		 472 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  27.18 
 
 		 394 aa  93.6  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0663  protein serine/threonine phosphatase  24.22 
 
 		 846 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0772  protein serine/threonine phosphatase  22.55 
 
 		 340 aa  93.2  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.155519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  23.4 
 
 		 566 aa  92.8  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  27.12 
 
 		 706 aa  92.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2329  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  25 
 
 		 748 aa  92.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.681955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0924  protein serine/threonine phosphatase  29.1 
 
 		 705 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0206766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0285  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  29.21 
 
 		 590 aa  92  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3781  protein serine/threonine phosphatase  26.26 
 
 		 682 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.597612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2542  putative PAS/PAC sensor protein  28.14 
 
 		 637 aa  91.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.17 
 
 		 412 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  23.75 
 
 		 667 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  27.93 
 
 		 543 aa  91.3  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  26.24 
 
 		 840 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  23.75 
 
 		 670 aa  91.3  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  25 
 
 		 723 aa  91.3  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  27.13 
 
 		 671 aa  90.5  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4768  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  24.9 
 
 		 1480 aa  90.5  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  24.56 
 
 		 661 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  26.92 
 
 		 393 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  26.92 
 
 		 393 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.06 
 
 		 400 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.92 
 
 		 393 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  26.16 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  26.42 
 
 		 394 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2100  putative phytochrome sensor protein  25.56 
 
 		 1082 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.758651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  27.1 
 
 		 394 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.77 
 
 		 413 aa  89.4  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2571  protein serine/threonine phosphatase  28.51 
 
 		 251 aa  88.6  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1034  serine phosphatase  27.9 
 
 		 657 aa  88.2  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.363203  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  24.22 
 
 		 404 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.83 
 
 		 602 aa  88.2  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3094  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 519 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1450  hypothetical protein  26.42 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  27.1 
 
 		 394 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5090  protein serine/threonine phosphatase  27.27 
 
 		 487 aa  87.4  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>