65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3047 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3047  serine phosphatase  100 
 
 		 397 aa  822    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1841  stage II sporulation E family protein  40 
 
 		 616 aa  220  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4266  protein serine/threonine phosphatase  36.16 
 
 		 614 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1432  protein serine/threonine phosphatase  41.3 
 
 		 403 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1551  signal domain-containing protein  33.07 
 
 		 661 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02150  hypothetical protein  35.56 
 
 		 663 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.308967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0252  hypothetical protein  35.56 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0984  protein serine/threonine phosphatase  38.95 
 
 		 414 aa  176  5e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3040  protein serine/threonine phosphatase  43.36 
 
 		 410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298703  normal  0.49584 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3326  protein serine/threonine phosphatase  37.83 
 
 		 414 aa  170  3e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2259  serine phosphatase  38.6 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.913112  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1013  serine phosphatase  36.19 
 
 		 556 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1587  protein serine/threonine phosphatase  36.91 
 
 		 459 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.661001  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3125  protein serine/threonine phosphatase  37.83 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2356  protein serine/threonine phosphatase  30.43 
 
 		 679 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2114  protein serine/threonine phosphatase  31.9 
 
 		 666 aa  158  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5579  protein serine/threonine phosphatase  36.4 
 
 		 413 aa  158  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.79883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2929  serine phosphatase  38.38 
 
 		 410 aa  155  9e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.237417  normal  0.195412 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1786  protein serine/threonine phosphatase  37.25 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0195468 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2934  protein serine/threonine phosphatase  36 
 
 		 410 aa  150  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1473  protein serine/threonine phosphatase  33.98 
 
 		 558 aa  146  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4586  protein serine/threonine phosphatase  39.34 
 
 		 604 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.42006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  25.66 
 
 		 840 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0171  putative PAS/PAC sensor protein  25.81 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2931  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.69 
 
 		 563 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0258566  normal  0.261187 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1584  protein serine/threonine phosphatase  27.19 
 
 		 649 aa  63.5  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.63374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2204  serine phosphatase  22.87 
 
 		 644 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.206885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2023  protein serine/threonine phosphatase  23.73 
 
 		 648 aa  56.6  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.08 
 
 		 566 aa  56.2  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1514  diguanylate cyclase  31.4 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2520  stage II sporulation E family protein  25.25 
 
 		 683 aa  55.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.700414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1448  serine phosphatase  22.9 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0099  Serine phosphatase  25.12 
 
 		 663 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3802  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.71 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.477794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3753  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.71 
 
 		 393 aa  53.9  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1513  stage II sporulation E family protein  27.31 
 
 		 397 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0207  diguanylate cyclase  26.54 
 
 		 346 aa  53.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1596  serine phosphatase RsbU  21.92 
 
 		 521 aa  53.1  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.242086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1472  serine phosphatase  25.19 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2818  putative PAS/PAC sensor protein  25.66 
 
 		 649 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0833  response regulator  27.78 
 
 		 389 aa  49.3  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.106584  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0060  serine phosphatase  22.67 
 
 		 706 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0461367 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  22.84 
 
 		 708 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0731  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.73 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  23.74 
 
 		 543 aa  47.8  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6569  protein serine/threonine phosphatase  24.32 
 
 		 556 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0173  serine phosphatase  25.11 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.361934  normal  0.766765 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3014  stage II sporulation E family protein  23.48 
 
 		 723 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1522  response regulator receiver modulated serine phosphatase  20.21 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  21.19 
 
 		 378 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0083  serine phosphatase  21.38 
 
 		 559 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0823  putative PAS/PAC sensor protein  20.53 
 
 		 817 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5306  protein serine/threonine phosphatase  24.38 
 
 		 715 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0959  stage II sporulation E family protein  24.44 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0795  putative PAS/PAC sensor protein  20.53 
 
 		 817 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.17 
 
 		 384 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  22.01 
 
 		 496 aa  44.7  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3158  Stage II sporulation E family protein  21.94 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  22.45 
 
 		 426 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1034  putative PAS/PAC sensor protein  20.64 
 
 		 670 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188592 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1005  putative PAS/PAC sensor protein  20.64 
 
 		 667 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.56 
 
 		 1051 aa  43.5  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  24.75 
 
 		 660 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2152  putative response regulator, putative serine phosphatase  24.54 
 
 		 434 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2502  response regulator receiver modulated serine phosphatase  29.13 
 
 		 384 aa  43.1  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>