More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1479 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1479  response regulator receiver protein  100 
 
 		 402 aa  807    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  43.65 
 
 		 394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  43.91 
 
 		 394 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  43.4 
 
 		 394 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  43.99 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  40.4 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  39.8 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  40.82 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.65 
 
 		 412 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  39.9 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  39.8 
 
 		 394 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  39.9 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1112  response regulator receiver domain-containing protein  37.59 
 
 		 399 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1472  serine phosphatase  40.98 
 
 		 379 aa  216  4e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.95872  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3361  putative PAS/PAC sensor protein  30.42 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0825  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.36 
 
 		 526 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.126425  normal  0.339318 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.55 
 
 		 423 aa  106  6e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2166  putative PAS/PAC sensor protein  26.69 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.54 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1566  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  28.33 
 
 		 396 aa  103  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.244929 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1312  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000399806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1379  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00673289  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2546  response regulator receiver protein  26.95 
 
 		 376 aa  98.2  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0176  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.44 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3648  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.3 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2870  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 418 aa  97.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0302  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.88 
 
 		 400 aa  97.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1210  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0544929  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1372  response regulator receiver protein  26.13 
 
 		 367 aa  95.9  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0119088  hitchhiker  0.0000873565 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0329  putative response regulator  22.09 
 
 		 415 aa  95.9  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2647  response regulator receiver protein  26.02 
 
 		 418 aa  94.7  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0228439  normal  0.825958 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2938  protein serine/threonine phosphatase  28.03 
 
 		 634 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2906  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0132666  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2896  response regulator receiver protein  25.81 
 
 		 367 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00201335  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3038  response regulator receiver protein  25.45 
 
 		 367 aa  94.7  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0232368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3770  response regulator receiver protein  25.64 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112062 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1467  response regulator receiver protein  25.36 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0140274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1870  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.43 
 
 		 379 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.177859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1844  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.43 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1648  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 367 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0057956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2013  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.32 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.155477  normal  0.0155604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3196  response regulator  27.08 
 
 		 367 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2946  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.41 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2806  response regulator receiver protein  24.62 
 
 		 373 aa  91.3  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.37 
 
 		 391 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1391  response regulator receiver protein  25.57 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3485  response regulator  25.95 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1432  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.28 
 
 		 407 aa  90.5  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3036  response regulator receiver protein  24.01 
 
 		 367 aa  89.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.697745  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0921  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.32 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2943  response regulator receiver modulated serine phosphatase  24.28 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0583  response regulator receiver protein  25.88 
 
 		 394 aa  87.8  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2467  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.41 
 
 		 385 aa  87.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  27.3 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1723  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  28.15 
 
 		 381 aa  87  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00833768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4657  serine phosphatase  26 
 
 		 467 aa  87  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.767582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2673  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25.32 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0495  response regulator receiver protein  24.29 
 
 		 423 aa  86.7  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3723  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  26.13 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0976167  normal  0.601311 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0279  response regulator receiver modulated serine phosphatase  26.91 
 
 		 394 aa  85.1  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1628  response regulator receiver protein  28.09 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2998  response regulator receiver protein  26.54 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2082  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.83 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0999  response regulator receiver modulated serine phosphatase  25 
 
 		 602 aa  83.2  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  hitchhiker  0.00369461 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1396  response regulator receiver protein  23.57 
 
 		 367 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00425013  normal  0.314583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2155  protein serine/threonine phosphatase  28.42 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0441189  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1586  putative phytochrome sensor protein  30.42 
 
 		 1087 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0975529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2648  putative phytochrome sensor protein  32.09 
 
 		 1087 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1440  response regulator  25.21 
 
 		 391 aa  81.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0677305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0898  sigma factor sigB regulation protein  23.91 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.503671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1161  response regulator  23.91 
 
 		 380 aa  80.9  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1702  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.91 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1424  response regulator receiver modulated serine phosphatase  21.77 
 
 		 496 aa  80.5  0.00000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000007  serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  24.71 
 
 		 397 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.441967  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1070  response regulator  23.91 
 
 		 358 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.209800000000002e-41 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0930  response regulator  23.91 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0915  sigma factor sigB regulation protein  23.91 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116334  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0994  response regulator  23.91 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4268  response regulator  23.59 
 
 		 380 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568873 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1088  response regulator  23.91 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0905  response regulator receiver modulated serine phosphatase  23.59 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0205  response regulator receiver protein  26.12 
 
 		 395 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0071  response regulator receiver (CheY-like) modulated serine phosphatase  23.96 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  27.59 
 
 		 678 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3890  response regulator receiver protein  27.78 
 
 		 378 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1931  protein serine/threonine phosphatase  27.37 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.307044 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1830  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  26.1 
 
 		 941 aa  77  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1035  response regulator  23.32 
 
 		 380 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1356  response regulator receiver  24.17 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.235342  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0206  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  24.37 
 
 		 423 aa  75.5  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2749  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2179  sigma factor regulation protein  27.93 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.116997  normal  0.843172 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0115  Stage II sporulation E family protein  24.07 
 
 		 429 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.90623  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4027  cyclic nucleotide-binding protein  25.89 
 
 		 413 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2267  response regulator receiver protein  23.05 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0287525  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2410  protein serine/threonine phosphatase  29.44 
 
 		 660 aa  73.2  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05599  response regulator receiver  24.01 
 
 		 560 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1524  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 		 409 aa  73.6  0.000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2750  HAMP domain-containing protein  26.26 
 
 		 543 aa  72.8  0.000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.362683  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1487  stage II sporulation E family protein  26.35 
 
 		 535 aa  72.8  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>