More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3361 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3361  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
529 aa  1092    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3568  adenylate/guanylate cyclase  64.14 
 
 
526 aa  671    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.456079 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1999  adenylate/guanylate cyclase  62.31 
 
 
524 aa  688    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0289  adenylate/guanylate cyclase  58.21 
 
 
526 aa  610  1e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4495  adenylate/guanylate cyclase  58.7 
 
 
532 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0629136  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2124  adenylate/guanylate cyclase  49.4 
 
 
516 aa  478  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  50.36 
 
 
662 aa  292  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  48.23 
 
 
662 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4465  adenylate/guanylate cyclase  49.25 
 
 
561 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.419976 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  45.2 
 
 
479 aa  274  3e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  47.65 
 
 
738 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32750  Adenylate cyclase protein  43.2 
 
 
465 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.811274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  42.53 
 
 
462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  42.86 
 
 
446 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  41.3 
 
 
463 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  37.79 
 
 
460 aa  234  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1662  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 
472 aa  207  4e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.491568  hitchhiker  0.000617786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  43.4 
 
 
665 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
758 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  35.82 
 
 
752 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.2 
 
 
431 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.2 
 
 
441 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.6 
 
 
584 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.18 
 
 
584 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1610  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  36.79 
 
 
528 aa  142  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.23 
 
 
694 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.24 
 
 
611 aa  140  6e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.59 
 
 
638 aa  139  1e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.54 
 
 
658 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  37.91 
 
 
636 aa  138  3.0000000000000003e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.98 
 
 
672 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
744 aa  137  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.02 
 
 
656 aa  136  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.89 
 
 
864 aa  136  8e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
1156 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
746 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  35.09 
 
 
696 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  37.06 
 
 
1093 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0891  adenylate/guanylate cyclase  33.82 
 
 
822 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508191  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  30.22 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  35.34 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1003  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.95 
 
 
879 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.528155 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.38 
 
 
757 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0561  putative adenylate/guanylate cyclase  30.29 
 
 
817 aa  134  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.436202 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3040  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.82 
 
 
815 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.84 
 
 
936 aa  132  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  36.73 
 
 
1180 aa  132  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  32.63 
 
 
702 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0672  hypothetical protein  35.32 
 
 
487 aa  131  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  31.09 
 
 
701 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  35.27 
 
 
859 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.38 
 
 
861 aa  129  1.0000000000000001e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  32.83 
 
 
860 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  37.5 
 
 
971 aa  127  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  31.6 
 
 
735 aa  126  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  36.02 
 
 
546 aa  125  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  34.93 
 
 
729 aa  125  1e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  37.43 
 
 
761 aa  126  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  29.96 
 
 
701 aa  125  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1887  adenylate/guanylate cyclase  31.78 
 
 
403 aa  125  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
1207 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  34.4 
 
 
1172 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.33 
 
 
657 aa  124  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.55 
 
 
858 aa  124  6e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  33.82 
 
 
546 aa  123  9e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  30.04 
 
 
911 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 
744 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  34.18 
 
 
1081 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  33.65 
 
 
656 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  39.01 
 
 
696 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  35.42 
 
 
1089 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.05 
 
 
969 aa  119  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  31.84 
 
 
734 aa  119  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
726 aa  118  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.82 
 
 
678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 
712 aa  117  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.06 
 
 
794 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  32.77 
 
 
717 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  33.8 
 
 
667 aa  117  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  35.75 
 
 
632 aa  116  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  36.69 
 
 
675 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  30.7 
 
 
513 aa  116  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0045  adenylate/guanylate cyclase  34.27 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.04 
 
 
1080 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1597  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  34.88 
 
 
981 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000711164  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  35.71 
 
 
741 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.02 
 
 
577 aa  114  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
483 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  31.45 
 
 
536 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  31.13 
 
 
518 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.33 
 
 
737 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  31.34 
 
 
515 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  31.55 
 
 
645 aa  111  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  34.39 
 
 
701 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1802  adenylate/guanylate cyclase  34.07 
 
 
591 aa  111  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  34.41 
 
 
758 aa  110  6e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2195  putative adenylate/guanylate cyclase  31.68 
 
 
641 aa  110  7.000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.595097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  40 
 
 
652 aa  110  9.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.78 
 
 
754 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  38.24 
 
 
585 aa  109  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0981996 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>