More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2510 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2510  putative Chase2 sensor protein  100 
 
 		 753 aa  1518    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0278578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7152  adenylate/guanylate cyclase  31.17 
 
 		 744 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  31.22 
 
 		 756 aa  314  4.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.25 
 
 		 764 aa  311  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  31.45 
 
 		 760 aa  305  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  31.63 
 
 		 759 aa  302  2e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1740  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.93 
 
 		 753 aa  299  1e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.21931 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1553  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.48 
 
 		 754 aa  283  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.333757 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  32.39 
 
 		 729 aa  251  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  29.88 
 
 		 725 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3360  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.03 
 
 		 723 aa  245  3e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1674  adenylate/guanylate cyclase  28.17 
 
 		 731 aa  243  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3663  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  30.85 
 
 		 723 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93824  normal  0.384107 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  28.22 
 
 		 729 aa  219  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.97 
 
 		 737 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1112  adenylate/guanylate cyclase  25.32 
 
 		 721 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  26.46 
 
 		 741 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  23.54 
 
 		 758 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  23.4 
 
 		 758 aa  181  5.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  25.47 
 
 		 746 aa  177  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0929  adenylate/guanylate cyclase  24.23 
 
 		 738 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24 
 
 		 758 aa  173  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1969  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.98 
 
 		 696 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0397866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0302  putative Chase2 sensor protein  26.76 
 
 		 670 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5187  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.4 
 
 		 758 aa  158  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.56 
 
 		 656 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2382  adenylate/guanylate cyclase  24.71 
 
 		 752 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.56 
 
 		 657 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  22.91 
 
 		 794 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25 
 
 		 656 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.65 
 
 		 643 aa  139  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1858  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 		 734 aa  137  7.000000000000001e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.88873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3697  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 		 696 aa  136  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.61471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0057  putative Chase2 sensor protein  33.17 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712657 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  22.97 
 
 		 701 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.43 
 
 		 672 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.59 
 
 		 658 aa  122  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 		 593 aa  120  7e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.04 
 
 		 724 aa  117  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3720  putative Chase2 sensor protein  29.34 
 
 		 499 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104275  normal  0.235752 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2084  putative Chase2 sensor protein  27.73 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.478351 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0411  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  30.32 
 
 		 694 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0173822  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  26.76 
 
 		 701 aa  113  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  25.98 
 
 		 614 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0932  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  24.92 
 
 		 936 aa  112  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  26.94 
 
 		 717 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4017  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.27 
 
 		 701 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3884  adenylate/guanylate cyclase  24.11 
 
 		 667 aa  110  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  25.34 
 
 		 607 aa  110  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  27.88 
 
 		 903 aa  109  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.76 
 
 		 701 aa  109  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1993  stage II sporulation E family protein  28.61 
 
 		 708 aa  108  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  26.35 
 
 		 702 aa  107  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  23.15 
 
 		 797 aa  106  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  26.02 
 
 		 858 aa  105  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.94 
 
 		 757 aa  104  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 		 864 aa  104  7e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  19.94 
 
 		 641 aa  103  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0097  putative Chase2 sensor protein  26.04 
 
 		 635 aa  103  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  27.57 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  26.62 
 
 		 859 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  24.28 
 
 		 744 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1897  metal-dependent phosphohydrolase  28.04 
 
 		 671 aa  97.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 		 643 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.37 
 
 		 665 aa  97.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.98 
 
 		 637 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  25.38 
 
 		 645 aa  95.1  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4565  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  22.8 
 
 		 761 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.593943  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.62 
 
 		 735 aa  92.8  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1235  stage II sporulation E family protein  26.99 
 
 		 671 aa  91.7  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  24.79 
 
 		 861 aa  91.3  6e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3049  adenylate/guanylate cyclase  25.28 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  26.87 
 
 		 638 aa  89.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  23.35 
 
 		 860 aa  88.6  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  27.75 
 
 		 431 aa  87.8  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  28.43 
 
 		 441 aa  87.4  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0940  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  24.5 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326683  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  26.7 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  25 
 
 		 632 aa  85.5  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  26.7 
 
 		 483 aa  85.1  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.21 
 
 		 652 aa  85.1  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  23.62 
 
 		 712 aa  84.7  0.000000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0632  metal dependent phosphohydrolase  29.17 
 
 		 654 aa  84.7  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000219793  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  28.33 
 
 		 740 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3755  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.58 
 
 		 678 aa  82.4  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1986  adenylate cyclase, putative  26.87 
 
 		 636 aa  81.3  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000955851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  23.47 
 
 		 911 aa  80.9  0.00000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1638  putative adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.739692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  25.89 
 
 		 1207 aa  79.7  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  27.01 
 
 		 546 aa  79  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  31.36 
 
 		 546 aa  78.6  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2253  adenylate cyclase  28.19 
 
 		 518 aa  78.6  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0171825 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0108  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.08 
 
 		 648 aa  78.2  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0450692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  27.55 
 
 		 518 aa  78.2  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  23.53 
 
 		 1119 aa  78.2  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  30.72 
 
 		 514 aa  78.2  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18180  putative Chase2 sensor protein  26.38 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000385352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  21.65 
 
 		 643 aa  77.4  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  31.96 
 
 		 1160 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>