More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2390 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2390  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2339  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 239 aa  494  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3430  two component transcriptional regulator, winged helix family  63.27 
 
 		 231 aa  301  7.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2678  winged helix family two component transcriptional regulator  52.48 
 
 		 240 aa  239  4e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4914  two component transcriptional regulator  54.08 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.095278 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4236  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0556  two component transcriptional regulator  48.91 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.451756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1917  two component transcriptional regulator  46.41 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.332821 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2507  winged helix family two component transcriptional regulator  47.41 
 
 		 233 aa  197  9e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.71 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  36.75 
 
 		 297 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.36 
 
 		 224 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  35.56 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0541  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 230 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 247 aa  149  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.44 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  38.67 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 231 aa  149  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0841  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.22 
 
 		 223 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  35.65 
 
 		 229 aa  148  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2160  two component transcriptional regulator  36.48 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  38.72 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  37.71 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.34 
 
 		 228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  36.4 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.71 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.17 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  38.14 
 
 		 247 aa  145  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  39.11 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  37 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 232 aa  145  8.000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  36.86 
 
 		 240 aa  144  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  35.93 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.93 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  34.78 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  34.76 
 
 		 228 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  36.56 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 225 aa  143  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  36.02 
 
 		 232 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2062  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000169038  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2915  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.26 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.892207  normal  0.300351 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.5 
 
 		 235 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1790  response regulator  38.84 
 
 		 254 aa  143  3e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0306127  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1962  DNA-binding response regulator  39.56 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.597164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  35.71 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 229 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2121  two component transcriptional regulator  38.77 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  38.53 
 
 		 229 aa  142  6e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  38.33 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2103  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 240 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0666731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1546  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.86 
 
 		 237 aa  142  6e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1820  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3366  DNA-binding response regulator  39.11 
 
 		 225 aa  141  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.166078  hitchhiker  0.00000000000000126215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  36.96 
 
 		 228 aa  141  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06261  two-component response regulator  37.55 
 
 		 240 aa  141  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0419163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18360  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  35.14 
 
 		 239 aa  141  9e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  37.44 
 
 		 230 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  35.24 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0630  two component transcriptional regulator  36.05 
 
 		 232 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  34.32 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  35.17 
 
 		 239 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.48 
 
 		 231 aa  141  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.34 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18111  two-component response regulator  35.62 
 
 		 248 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0302  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.6 
 
 		 221 aa  141  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 229 aa  140  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1772  response regulator  38.39 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0142  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.04 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1712  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2231  two component transcriptional regulator  36.12 
 
 		 234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2600  two component transcriptional regulator  37.24 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  33.9 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18291  two-component response regulator  35.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.276613  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18081  two-component response regulator  35.62 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1930  two component transcriptional regulator  36.8 
 
 		 233 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.465475  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2041  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0972255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1816  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  36.32 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1955  DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2416  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0279623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.71 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  37.61 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  37.17 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.17 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.5 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  34.8 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>