More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0500 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0500  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
543 aa  1106    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  29.11 
 
 
546 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30820  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  35.32 
 
 
535 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0142633  hitchhiker  0.0000000000042709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 
557 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  27.97 
 
 
546 aa  190  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
532 aa  182  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  28.03 
 
 
541 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.5 
 
 
674 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.12 
 
 
543 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 
677 aa  176  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.787316  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.11 
 
 
671 aa  176  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2240  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  30.29 
 
 
537 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.942924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.48 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.49 
 
 
547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.54 
 
 
542 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  26.55 
 
 
542 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.88 
 
 
549 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2188  histidine kinase  37.1 
 
 
540 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.035953  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2100  chemotaxis sensory transducer  29.37 
 
 
537 aa  171  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.517374  normal  0.435335 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  28.61 
 
 
544 aa  170  5e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 
547 aa  171  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3112  chemotaxis sensory transducer  36.05 
 
 
541 aa  169  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
541 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00226615  normal  0.196783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3076  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.31 
 
 
541 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000214454  normal  0.805143 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1988  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
674 aa  168  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588025  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.5 
 
 
807 aa  168  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.41 
 
 
807 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.29 
 
 
640 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.01 
 
 
539 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.93 
 
 
541 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  28.21 
 
 
544 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  26.94 
 
 
541 aa  166  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3664  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 
562 aa  166  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248385  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.34 
 
 
541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2112  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.6 
 
 
571 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.4 
 
 
540 aa  164  3e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  29.54 
 
 
541 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.29 
 
 
544 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0594  methyl-accepting chemotaxis protein  33.6 
 
 
658 aa  163  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  28.9 
 
 
543 aa  163  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  31.88 
 
 
629 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.68 
 
 
650 aa  163  8.000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 
658 aa  163  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.2 
 
 
601 aa  163  9e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1460  methyl-accepting chemotaxis transducer transmembrane protein  29.6 
 
 
513 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.75608 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 
540 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  27.39 
 
 
570 aa  163  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.92 
 
 
525 aa  162  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
660 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1371  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  37.59 
 
 
544 aa  161  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116754  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2933  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
540 aa  161  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.3489100000000001e-18  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.76 
 
 
541 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.51 
 
 
550 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.38 
 
 
807 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2259  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.14 
 
 
588 aa  161  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.131825  normal  0.497854 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  26.73 
 
 
546 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.7 
 
 
544 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.38 
 
 
564 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.208452  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  32.56 
 
 
541 aa  160  5e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3772  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 
565 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.430546 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4591  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.2 
 
 
565 aa  160  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.521693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.48 
 
 
541 aa  160  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 
660 aa  160  7e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3609  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.44 
 
 
596 aa  160  7e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  31.75 
 
 
632 aa  160  8e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  32.13 
 
 
681 aa  160  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.58 
 
 
541 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0507  methyl-accepting chemotaxis I  27.91 
 
 
600 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
650 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3246  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.16 
 
 
601 aa  159  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.416407  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.15 
 
 
541 aa  159  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  33.07 
 
 
650 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0614  methyl-accepting chemotaxis protein  32.35 
 
 
658 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.7 
 
 
628 aa  159  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.65 
 
 
540 aa  159  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  30.57 
 
 
392 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  31.76 
 
 
676 aa  158  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.3 
 
 
587 aa  159  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.352371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1208  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 
555 aa  159  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000392698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.08 
 
 
544 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.62 
 
 
632 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 
580 aa  159  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0469  methyl-accepting chemotaxis protein  32.35 
 
 
658 aa  158  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  30.26 
 
 
539 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.39 
 
 
818 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215675  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
541 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
638 aa  157  4e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1084  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.74 
 
 
541 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0303  methyl-accepting chemotaxis transmembrane protein  28.8 
 
 
515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0526  methyl-accepting chemotaxis protein  32.35 
 
 
658 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3458  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.27 
 
 
576 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
640 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0558  methyl-accepting chemotaxis protein  32.35 
 
 
658 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.23 
 
 
550 aa  157  6e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1363  PAS  36.84 
 
 
544 aa  157  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3274  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 
541 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0175031  normal  0.083895 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.02 
 
 
541 aa  156  7e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 
649 aa  157  7e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2521  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.86 
 
 
533 aa  157  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>