More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0229 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
807 aa  1616    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  92.81 
 
 
807 aa  1511    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.344812 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3087  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57 
 
 
807 aa  848    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.64 
 
 
816 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2507  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.46 
 
 
818 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00215675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0476  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.41 
 
 
830 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2677  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.79 
 
 
818 aa  300  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.730239  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.62 
 
 
423 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3805  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
422 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000721713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 
557 aa  198  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.64 
 
 
540 aa  196  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.89 
 
 
540 aa  193  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  39.75 
 
 
541 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
540 aa  191  5e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.86 
 
 
546 aa  191  5.999999999999999e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
661 aa  189  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  32.7 
 
 
544 aa  187  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  32.47 
 
 
674 aa  187  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.59 
 
 
674 aa  187  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.47 
 
 
542 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.62 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  35.18 
 
 
543 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
541 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.9 
 
 
541 aa  184  6e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.19 
 
 
544 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.36 
 
 
541 aa  181  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.52 
 
 
544 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.66 
 
 
650 aa  181  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.65 
 
 
637 aa  181  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.8 
 
 
544 aa  181  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.71 
 
 
425 aa  180  9e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.27 
 
 
539 aa  180  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  32.48 
 
 
642 aa  180  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  35.03 
 
 
676 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.29 
 
 
541 aa  179  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.88 
 
 
542 aa  179  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
549 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.84 
 
 
681 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.35 
 
 
540 aa  178  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.43 
 
 
642 aa  178  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2432  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
555 aa  178  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0013651  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
541 aa  177  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  34.4 
 
 
549 aa  177  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  35.69 
 
 
543 aa  177  6e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 
570 aa  177  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
543 aa  177  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.28 
 
 
565 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.71 
 
 
549 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.1 
 
 
545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.17 
 
 
570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0614  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.33 
 
 
747 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05691  histidine kinase  33.72 
 
 
538 aa  174  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.01 
 
 
541 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  33.9 
 
 
541 aa  174  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
666 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5515  chemotaxis sensory transducer  32.88 
 
 
658 aa  174  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.501051  normal  0.584272 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.81 
 
 
550 aa  173  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.61 
 
 
538 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  34.46 
 
 
546 aa  172  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 
542 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.18 
 
 
541 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  35.45 
 
 
541 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0117  methyl-accepting chemotaxis protein  31.91 
 
 
658 aa  172  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 
541 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.14 
 
 
624 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.7 
 
 
522 aa  171  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.23 
 
 
700 aa  171  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1624  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
626 aa  171  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.835429  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  34.3 
 
 
712 aa  171  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2870  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.94 
 
 
636 aa  171  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.85 
 
 
547 aa  170  8e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  33.04 
 
 
541 aa  170  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0071  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.03 
 
 
658 aa  170  9e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.5 
 
 
537 aa  170  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  31.34 
 
 
546 aa  169  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  33.43 
 
 
633 aa  169  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
540 aa  170  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.73 
 
 
538 aa  170  1e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2502  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.68 
 
 
649 aa  169  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.988754  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.51 
 
 
716 aa  169  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2834  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.44 
 
 
671 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.188903  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2782  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.67 
 
 
601 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 
674 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0157  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.94 
 
 
646 aa  168  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.805637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  33.53 
 
 
541 aa  168  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  35.82 
 
 
539 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.94 
 
 
634 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  33.72 
 
 
712 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.23 
 
 
544 aa  167  8e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  35.1 
 
 
634 aa  167  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
636 aa  167  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.28 
 
 
673 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2309  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  34.08 
 
 
547 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.037772  hitchhiker  0.0000415162 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1881  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.99 
 
 
592 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3621  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.03 
 
 
555 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.30858 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  31.67 
 
 
392 aa  165  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3948  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.65 
 
 
658 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 
620 aa  165  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.6 
 
 
549 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  34.19 
 
 
543 aa  165  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>