More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4266 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  64.1 
 
 
546 aa  681    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
546 aa  1085    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  57.88 
 
 
570 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  57.51 
 
 
546 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  55.86 
 
 
542 aa  543  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
541 aa  395  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.45 
 
 
425 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.99 
 
 
541 aa  375  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  47.71 
 
 
541 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.76 
 
 
541 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  48.18 
 
 
541 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.1 
 
 
541 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  50.42 
 
 
541 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  61.89 
 
 
541 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  60.17 
 
 
541 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  50.22 
 
 
541 aa  363  6e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.71 
 
 
541 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.23 
 
 
541 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  46.01 
 
 
541 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 
541 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.25 
 
 
541 aa  353  4e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
541 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.67 
 
 
541 aa  352  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  47.69 
 
 
541 aa  342  7e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  48.6 
 
 
541 aa  342  1e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.7 
 
 
541 aa  340  5e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  57.19 
 
 
541 aa  339  8e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  57.62 
 
 
541 aa  336  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
539 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  47.69 
 
 
541 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  41.17 
 
 
539 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.68 
 
 
542 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.14 
 
 
540 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  51.07 
 
 
550 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  50.96 
 
 
551 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  41.01 
 
 
542 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.17 
 
 
541 aa  316  8e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.78 
 
 
539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.4 
 
 
539 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  51.01 
 
 
541 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  38.31 
 
 
541 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
539 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.58 
 
 
541 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.84 
 
 
540 aa  300  4e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.44 
 
 
546 aa  300  5e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.03 
 
 
550 aa  300  7e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.44 
 
 
541 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.31 
 
 
540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  36.93 
 
 
557 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 
542 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  41.16 
 
 
542 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.71 
 
 
558 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  36.08 
 
 
542 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  50.74 
 
 
539 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.45 
 
 
543 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
639 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.82 
 
 
619 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.57 
 
 
544 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  43.5 
 
 
633 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.06 
 
 
634 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
640 aa  250  4e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  32.31 
 
 
546 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  43.5 
 
 
629 aa  247  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0728  chemotaxis sensory transducer  44.63 
 
 
639 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
642 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  44.06 
 
 
676 aa  241  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  42.86 
 
 
642 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
638 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.07 
 
 
638 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.19 
 
 
681 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.28 
 
 
638 aa  239  8e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.79 
 
 
638 aa  239  1e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  41.85 
 
 
543 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.18 
 
 
640 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.04 
 
 
522 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  45.72 
 
 
647 aa  237  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.82 
 
 
650 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.32 
 
 
640 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.76 
 
 
638 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  43.64 
 
 
640 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
639 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.24 
 
 
637 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
679 aa  233  6e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.54 
 
 
637 aa  232  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.61 
 
 
541 aa  231  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.63 
 
 
542 aa  231  3e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.54 
 
 
647 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.06 
 
 
557 aa  230  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
639 aa  229  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.35 
 
 
636 aa  229  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  46.61 
 
 
647 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.54 
 
 
739 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.55 
 
 
653 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00297466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 
647 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  32.32 
 
 
543 aa  228  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.18 
 
 
639 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.27 
 
 
647 aa  226  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  31.53 
 
 
542 aa  226  8e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.54 
 
 
541 aa  226  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>