More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2054 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.96 
 
 
539 aa  639    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
539 aa  1060    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  61.78 
 
 
539 aa  628  1e-179  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.72 
 
 
541 aa  474  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.54 
 
 
541 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.98 
 
 
541 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.35 
 
 
541 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  45.19 
 
 
541 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  44.32 
 
 
541 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  43.78 
 
 
541 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.13 
 
 
541 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.22 
 
 
541 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  46.34 
 
 
541 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  43.76 
 
 
541 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
541 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.87 
 
 
541 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 
541 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.05 
 
 
541 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.74 
 
 
541 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 
541 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  41.77 
 
 
541 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  41.22 
 
 
541 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  41.77 
 
 
539 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.77 
 
 
539 aa  361  1e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  41.86 
 
 
541 aa  360  5e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  41.82 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  43.77 
 
 
541 aa  356  6.999999999999999e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.53 
 
 
425 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.85 
 
 
546 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.96 
 
 
540 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.59 
 
 
542 aa  348  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
542 aa  347  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.41 
 
 
570 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.03 
 
 
541 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  39.21 
 
 
541 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  38.98 
 
 
541 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  38.79 
 
 
542 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 
546 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  39.85 
 
 
541 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  39 
 
 
541 aa  317  3e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.19 
 
 
539 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
540 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 
542 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  37.32 
 
 
542 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  36.5 
 
 
551 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
542 aa  293  4e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  35.75 
 
 
550 aa  292  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  37.29 
 
 
557 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
558 aa  280  4e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.15 
 
 
550 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.63 
 
 
541 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.79 
 
 
541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.73 
 
 
540 aa  267  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  34.07 
 
 
543 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.99 
 
 
640 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  44.99 
 
 
629 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  44.44 
 
 
619 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  44.16 
 
 
633 aa  249  9e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.85 
 
 
638 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.31 
 
 
639 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.22 
 
 
546 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.47 
 
 
557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.48 
 
 
681 aa  243  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.23 
 
 
638 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  45.81 
 
 
647 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 
650 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
638 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.02 
 
 
640 aa  242  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 
540 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
544 aa  240  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.92 
 
 
638 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  42.65 
 
 
676 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.5 
 
 
543 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  30.76 
 
 
546 aa  236  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1434  methyl-accepting chemotaxis protein  31.24 
 
 
543 aa  236  7e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  45.21 
 
 
647 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.22 
 
 
642 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.94 
 
 
642 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 
634 aa  231  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 
638 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.89 
 
 
522 aa  228  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.06 
 
 
638 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.89 
 
 
541 aa  225  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  43.87 
 
 
640 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3925  methyl-accepting chemotaxis protein  40.56 
 
 
674 aa  224  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.903723  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.9 
 
 
632 aa  223  7e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.36 
 
 
540 aa  223  8e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  38.55 
 
 
639 aa  223  9e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000152719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4528  methyl-accepting chemotaxis protein  43.18 
 
 
672 aa  222  9.999999999999999e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
647 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  43.31 
 
 
647 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
640 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0444  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.91 
 
 
647 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414929  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
647 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0828859  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 
624 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.86 
 
 
637 aa  220  6e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
639 aa  219  7e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 
739 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.247309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
639 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>