More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2878 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2997  methyl-accepting chemotaxis protein  86.88 
 
 
542 aa  902    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.686035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2878  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
542 aa  1074    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.425048  normal  0.909341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  61.67 
 
 
542 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.470345  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
541 aa  383  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  44.3 
 
 
541 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
541 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.8 
 
 
558 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  42.94 
 
 
541 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  43.12 
 
 
541 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  42.57 
 
 
541 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
541 aa  349  8e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  43.25 
 
 
541 aa  349  9e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  42.41 
 
 
541 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.75 
 
 
541 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  42.64 
 
 
557 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4218  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.04 
 
 
541 aa  345  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.599163 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.99 
 
 
542 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  41.67 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.41 
 
 
540 aa  335  9e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
541 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.91 
 
 
541 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
541 aa  331  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.96 
 
 
541 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.89 
 
 
541 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.33 
 
 
541 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  40.26 
 
 
542 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5569  methyl-accepting chemotaxis protein  41.76 
 
 
541 aa  326  6e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  39.52 
 
 
541 aa  326  7e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.59 
 
 
541 aa  326  7e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.85 
 
 
541 aa  325  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
541 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.78 
 
 
541 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.82 
 
 
541 aa  324  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.89 
 
 
541 aa  323  4e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  40.7 
 
 
541 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  45.09 
 
 
541 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.05 
 
 
425 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.817651  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2634  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 
542 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.917034  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 
539 aa  293  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.910778 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3351  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  42.46 
 
 
570 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0540062  normal  0.0241334 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3580  methyl-accepting chemotaxis protein  41.56 
 
 
546 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  36.54 
 
 
546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.13 
 
 
539 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2109  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 
539 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.950044  normal  0.0787865 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2773  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.97 
 
 
540 aa  283  4.0000000000000003e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  35.65 
 
 
546 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1438  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.86 
 
 
540 aa  276  9e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2319  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
546 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.217936  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
541 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608007  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2643  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.69 
 
 
550 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0855376  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.86 
 
 
541 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.799555  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2054  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.23 
 
 
539 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  47.13 
 
 
551 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  46.26 
 
 
550 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.48 
 
 
639 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  31.05 
 
 
546 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0379  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.7 
 
 
647 aa  220  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.454626  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.7 
 
 
544 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  31.26 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
634 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.46 
 
 
568 aa  213  9e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
540 aa  212  2e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5160  methyl-accepting chemotaxis protein  40.18 
 
 
647 aa  210  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.391343  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.96 
 
 
541 aa  209  8e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43220  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  37.53 
 
 
652 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
638 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
638 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  41.09 
 
 
629 aa  207  5e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.24 
 
 
638 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.18 
 
 
650 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.25 
 
 
638 aa  207  5e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  42.06 
 
 
647 aa  206  7e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 
640 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
638 aa  204  4e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.64 
 
 
638 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.76 
 
 
522 aa  201  1.9999999999999998e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
640 aa  200  5e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.11 
 
 
547 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  39.53 
 
 
633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.4 
 
 
674 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  29.89 
 
 
542 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  40.86 
 
 
640 aa  196  6e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 
681 aa  197  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40 
 
 
541 aa  196  8.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  37.13 
 
 
676 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.57 
 
 
640 aa  196  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4192  chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
654 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.16 
 
 
619 aa  195  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  36.78 
 
 
642 aa  194  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.29 
 
 
634 aa  194  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  42.18 
 
 
647 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  28.62 
 
 
543 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  29.98 
 
 
543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.9 
 
 
621 aa  190  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.65 
 
 
637 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.21 
 
 
642 aa  189  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.36 
 
 
541 aa  188  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5071  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.08 
 
 
647 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 
674 aa  187  4e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>