More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003886 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_003886  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
542 aa  1090    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3236  methyl-accepting chemotaxis protein  42.83 
 
 
544 aa  385  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0210  methyl-accepting chemotaxis protein  38.99 
 
 
543 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000824359  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0931  methyl-accepting chemotaxis protein  40.11 
 
 
543 aa  349  7e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000055  methyl-accepting chemotaxis protein  38.04 
 
 
543 aa  348  1e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000458726  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 
546 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  40.52 
 
 
633 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.74 
 
 
642 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1491  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.75 
 
 
539 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4624  methyl-accepting chemotaxis protein  31.75 
 
 
539 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140064  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0447  chemotaxis sensory transducer  32.51 
 
 
541 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0317  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 
541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  decreased coverage  0.0000342214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0339  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 
541 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.722367  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  40.74 
 
 
642 aa  233  7.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.68 
 
 
619 aa  230  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.64 
 
 
624 aa  228  3e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.05 
 
 
555 aa  227  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4266  chemotaxis sensory transducer  31.53 
 
 
546 aa  226  8e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261421  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1334  methyl-accepting chemotaxis protein  32.3 
 
 
550 aa  226  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  36.68 
 
 
640 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  38.06 
 
 
629 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1630  chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 
541 aa  223  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.82 
 
 
638 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
638 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2907  chemotaxis sensory transducer  31.42 
 
 
541 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1418  chemotaxis sensory transducer  31.27 
 
 
541 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
638 aa  221  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1124  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.25 
 
 
547 aa  220  5e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00163985  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1150  chemotaxis sensory transducer  31.03 
 
 
551 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.11 
 
 
544 aa  220  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
650 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1426  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.89 
 
 
634 aa  219  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  32.08 
 
 
541 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  39.65 
 
 
681 aa  219  1e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67010  putative chemotaxis transducer  40.65 
 
 
647 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0340  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.66 
 
 
541 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.582352  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
638 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3266  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.57 
 
 
543 aa  216  7e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.51 
 
 
639 aa  216  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 
547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 
640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.4 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.452969  normal  0.355365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4833  chemotaxis sensory transducer  30.6 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000956827  normal  0.082646 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0921  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.14 
 
 
541 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43710  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  31.42 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3680  methyl-accepting chemotaxis protein  38.55 
 
 
676 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3114  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  28.86 
 
 
541 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.860602  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.17 
 
 
541 aa  212  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.04 
 
 
547 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.12 
 
 
638 aa  212  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3441  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
541 aa  211  3e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 
638 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4706  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.96 
 
 
541 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0897  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
541 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5092  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  37.83 
 
 
640 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3666  chemotaxis transducer  31.74 
 
 
541 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.260935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3279  methyl-accepting chemotaxis protein  29.44 
 
 
541 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3577  methyl-accepting chemotaxis protein  32.19 
 
 
542 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5811  putative chemotaxis transducer  40.95 
 
 
647 aa  210  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3284  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.02 
 
 
522 aa  208  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.26 
 
 
620 aa  208  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.64 
 
 
568 aa  208  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1091  chemotaxis sensory transducer  39.66 
 
 
620 aa  207  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0174472  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5553  methyl-accepting chemotaxis protein  38.04 
 
 
640 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2263  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.39 
 
 
541 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  40.9 
 
 
541 aa  206  8e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000566108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0931  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.35 
 
 
541 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.476721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2268  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.16 
 
 
541 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255239  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3348  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.05 
 
 
542 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.946905  normal  0.024921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0995  methyl-accepting chemotaxis protein  31.2 
 
 
557 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.467879  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4541  methyl-accepting chemotaxis protein  30.84 
 
 
541 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.726322  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0860  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
558 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.38 
 
 
541 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.63 
 
 
541 aa  205  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3424  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.36 
 
 
674 aa  205  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.560716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48030  putative methyl-accepting chemotaxis transducer  31.34 
 
 
541 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.478475 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4658  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
639 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.415489  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.02 
 
 
557 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4520  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.52 
 
 
639 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.886367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0868  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.07 
 
 
546 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2091  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.11 
 
 
541 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.596764  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0378  chemotaxis sensory transducer  40.42 
 
 
638 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.68857  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.29 
 
 
634 aa  204  4e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4141  chemotaxis transducer  37.91 
 
 
541 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.38 
 
 
543 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.26 
 
 
637 aa  203  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2301  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.04 
 
 
632 aa  203  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0778  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.32 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.66043 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
674 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.95 
 
 
549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.37 
 
 
620 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.22 
 
 
639 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3118  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
673 aa  201  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2315  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  40.2 
 
 
653 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.967368  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0902  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.69 
 
 
673 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.73728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.34 
 
 
541 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2309  methyl-accepting chemotaxis protein-like protein  33.91 
 
 
547 aa  200  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.037772  hitchhiker  0.0000415162 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3212  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.41 
 
 
673 aa  200  6e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.990285  normal  0.659639 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2593  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.96 
 
 
540 aa  200  6e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.591477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.6 
 
 
552 aa  200  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>