More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0241 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  96.43 
 
 		 393 aa  739    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0241  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 		 393 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0575576 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0916  methyl-accepting chemotaxis protein  61.89 
 
 		 394 aa  474  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00484593  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.11 
 
 		 393 aa  341  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000818802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2652  methyl-accepting chemotaxis protein  44.06 
 
 		 392 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.12 
 
 		 388 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2857  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.51 
 
 		 392 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0205381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1357  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.26 
 
 		 392 aa  273  3e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9116599999999996e-27 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.61 
 
 		 540 aa  257  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.81 
 
 		 540 aa  256  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.31 
 
 		 540 aa  253  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3147  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.99 
 
 		 540 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0302394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3964  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.25 
 
 		 535 aa  250  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000408371 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3107  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.9 
 
 		 542 aa  249  5e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3876  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 		 535 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.74566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.56 
 
 		 549 aa  242  1e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1221  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.86 
 
 		 544 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000143655  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.24 
 
 		 557 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0529  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.02 
 
 		 544 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 		 547 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1041  methyl-accepting chemotaxis protein  41.59 
 
 		 541 aa  239  5.999999999999999e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.893443  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.72 
 
 		 533 aa  237  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  42.41 
 
 		 528 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.22 
 
 		 674 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2854  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.04 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2326  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.03 
 
 		 547 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2942  methyl-accepting chemotaxis protein  39.66 
 
 		 544 aa  232  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0612  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.16 
 
 		 543 aa  230  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1884  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.86 
 
 		 547 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114501  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  39.55 
 
 		 549 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2825  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.49 
 
 		 570 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000443347 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 		 700 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0784998 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2890  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.17 
 
 		 549 aa  226  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.824592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.64 
 
 		 544 aa  225  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.839191  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.03 
 
 		 538 aa  224  3e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  40.51 
 
 		 549 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 524 aa  223  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.05372e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1029  methyl-accepting chemotaxis protein  42.38 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392996  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0889  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.8 
 
 		 540 aa  222  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1032  methyl-accepting chemotaxis protein  42.24 
 
 		 645 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1374  methyl-accepting chemotaxis protein  41.91 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.46 
 
 		 541 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0712  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.65 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.06 
 
 		 700 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.424843  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3345  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.92 
 
 		 542 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0226154 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  38.03 
 
 		 632 aa  220  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2828  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.61 
 
 		 550 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000014913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  40.61 
 
 		 546 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1041  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.27 
 
 		 661 aa  218  2e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0724  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.23 
 
 		 539 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1033  methyl-accepting chemotaxis protein  40.66 
 
 		 533 aa  216  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.46 
 
 		 533 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0756  methyl-accepting chemotaxis protein  40.55 
 
 		 549 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.3 
 
 		 546 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0750  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.55 
 
 		 539 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.8 
 
 		 545 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.27 
 
 		 532 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2579  methyl-accepting chemotaxis protein  41.64 
 
 		 543 aa  211  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2152  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.25 
 
 		 474 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000647381  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.76 
 
 		 542 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1021  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 		 518 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.4 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0235494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0042  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.62 
 
 		 565 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.121118  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3045  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.82 
 
 		 563 aa  205  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000317109  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0461  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.57 
 
 		 569 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1035  methyl-accepting chemotaxis protein  39.55 
 
 		 549 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.640997  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0960  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.71 
 
 		 666 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000181378  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.4 
 
 		 518 aa  199  6e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  36.44 
 
 		 539 aa  199  7e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0771  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.99 
 
 		 822 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.76 
 
 		 640 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 549 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3312  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.08 
 
 		 533 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0728  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.61 
 
 		 537 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0039  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.56 
 
 		 515 aa  192  8e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0381098 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3465  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.61 
 
 		 423 aa  192  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.24 
 
 		 515 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1891  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.92 
 
 		 509 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.745334  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.46 
 
 		 540 aa  190  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.566239  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.97 
 
 		 639 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523103  normal  0.0331864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0445  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.95 
 
 		 638 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.455391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0732  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.72 
 
 		 555 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.177926 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.59 
 
 		 640 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.37 
 
 		 658 aa  181  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1714  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 		 673 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.712235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2177  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.19 
 
 		 628 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5020  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.64 
 
 		 638 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  34.01 
 
 		 629 aa  179  7e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0380  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  33.05 
 
 		 638 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.58 
 
 		 624 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0466  methyl-accepting chemotaxis protein  34.63 
 
 		 541 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2616  methyl-accepting chemotaxis protein  31.52 
 
 		 633 aa  179  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00438795  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.38 
 
 		 696 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000015868 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  33.24 
 
 		 696 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4894  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 638 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.291281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2966  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.89 
 
 		 642 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.249585  normal  0.113943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  32.43 
 
 		 713 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5070  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.02 
 
 		 638 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1488  methyl-accepting chemotaxis protein  34.93 
 
 		 672 aa  177  4e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.619219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2356  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  31.52 
 
 		 619 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0809243  normal  0.398562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>