More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4182 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4182  GAF sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 389 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  53.45 
 
 		 394 aa  318  9e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  51.93 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 640 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  33.94 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 399 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1082  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.79 
 
 		 401 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1055  putative signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.64157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1071  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.13 
 
 		 401 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0809665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  35.4 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  35 
 
 		 392 aa  127  3e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  35.94 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 403 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 		 779 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  36.71 
 
 		 379 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 748 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  37.5 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  34.58 
 
 		 388 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1265  two-component sensor histidine kinase  33.97 
 
 		 585 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1193  histidine kinase  33.47 
 
 		 497 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0280854  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.61 
 
 		 658 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.17 
 
 		 662 aa  116  6e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  37.14 
 
 		 353 aa  116  7.999999999999999e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  34.93 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  36.73 
 
 		 662 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_373  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0559697  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 357 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.414543  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0431  sensory box sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.431568  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  35.86 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0649  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3254  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 		 561 aa  113  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  35.65 
 
 		 772 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1316  sensor histidine protein kinase  33.97 
 
 		 525 aa  112  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.176896  normal  0.0650582 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 359 aa  111  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0699  histidine kinase  31.78 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00253859  normal  0.376247 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  37.04 
 
 		 640 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1701  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 521 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279897 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 546 aa  109  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5739  putative signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02702  histidine kinase  34.86 
 
 		 456 aa  108  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3926  histidine kinase  35.43 
 
 		 598 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  31.19 
 
 		 387 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.504244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0895  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.622783  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003135  sensor histidine kinase  32.91 
 
 		 451 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.291514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1261  sensor histidine kinase  34.93 
 
 		 467 aa  107  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1399  PAS  32.6 
 
 		 683 aa  107  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.04458 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 339 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3575  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.65 
 
 		 475 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  37.75 
 
 		 309 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 535 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  35.44 
 
 		 489 aa  106  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  35.48 
 
 		 481 aa  106  7e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 775 aa  106  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  33.01 
 
 		 381 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1122  histidine kinase  32.73 
 
 		 357 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277853  normal  0.812788 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 574 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 544 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3211  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 394 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 770 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  36.98 
 
 		 384 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 552 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 545 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3594  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 598 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  39.27 
 
 		 467 aa  104  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  32.86 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 596 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492042 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 545 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 		 695 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  35.81 
 
 		 460 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 		 480 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2703  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.62 
 
 		 552 aa  103  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.191431 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  32.95 
 
 		 393 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 650 aa  103  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1238  histidine kinase  32.42 
 
 		 377 aa  103  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  34.1 
 
 		 1226 aa  103  7e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1372  sensor histidine kinase  30.3 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  29.95 
 
 		 783 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4714  Two-component sensor histidine kinase  33.92 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982334  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3230  sensory box histidine kinase  33.49 
 
 		 518 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  37.02 
 
 		 422 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 471 aa  101  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 459 aa  101  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  36.7 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4642  putative signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 412 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  34.86 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  32.16 
 
 		 396 aa  100  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2291  histidine kinase  33.07 
 
 		 596 aa  100  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3762  histidine kinase  34.23 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011366  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 748 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5329  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.44 
 
 		 595 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5321  putative signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 417 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0967984  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 		 523 aa  100  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5408  histidine kinase  36.73 
 
 		 494 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0406252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4627  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 603 aa  99.8  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 352 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 1229 aa  99.8  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>