46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_52710 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_52710  predicted protein  100 
 
 		 682 aa  1376    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.120093 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00409  Leucine Rich Repeat domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04960)  34.53 
 
 		 807 aa  148  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000909963  normal  0.437099 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00740  hypothetical protein  32.56 
 
 		 670 aa  73.6  0.00000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.309758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.95 
 
 		 1107 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  37.07 
 
 		 1266 aa  61.2  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  35.94 
 
 		 1052 aa  57  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10088  protein phosphatase PP1 regulatory subunit Sds22, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04800)  29.44 
 
 		 355 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.580332  normal  0.688338 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  26.79 
 
 		 863 aa  55.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  28.16 
 
 		 482 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  29.83 
 
 		 508 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  30.57 
 
 		 1263 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  29.41 
 
 		 1481 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  34.91 
 
 		 354 aa  52  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.52 
 
 		 1024 aa  52  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1627  hypothetical protein  34.17 
 
 		 647 aa  51.6  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.543561 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3526  leucine-rich repeat-containing protein  29.65 
 
 		 1481 aa  51.6  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  35.04 
 
 		 384 aa  51.6  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  36.36 
 
 		 643 aa  50.8  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  34.75 
 
 		 1041 aa  51.2  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  34.86 
 
 		 772 aa  50.8  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  38.95 
 
 		 1351 aa  50.4  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  33.72 
 
 		 770 aa  50.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  33.33 
 
 		 892 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  36.45 
 
 		 867 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35741  predicted protein  26.29 
 
 		 1370 aa  49.3  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  33.06 
 
 		 2324 aa  48.1  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  37.38 
 
 		 1015 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  26.8 
 
 		 558 aa  47.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  34.83 
 
 		 1744 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  29.55 
 
 		 925 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  32.11 
 
 		 937 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1837  leucine-rich repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1494 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  32.11 
 
 		 937 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  31.58 
 
 		 675 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  33.33 
 
 		 1088 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  39.76 
 
 		 760 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3326  leucine-rich repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1395 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.902358 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.83 
 
 		 1112 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.71 
 
 		 713 aa  45.4  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  31.3 
 
 		 1070 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  31.3 
 
 		 1070 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  33.08 
 
 		 1749 aa  45.1  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2369  leucine-rich repeat-containing protein  27.73 
 
 		 1395 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  34.13 
 
 		 307 aa  44.3  0.008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0949  leucine-rich repeat protein  26.02 
 
 		 755 aa  43.9  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.697592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  26.92 
 
 		 434 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>