37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2736 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2736  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  247  3e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6345  hypothetical protein  52.59 
 
 		 157 aa  89.4  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1748  hypothetical protein  49.38 
 
 		 1408 aa  70.9  0.000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1187  hypothetical protein  50.7 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.8029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  39.13 
 
 		 1421 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  37.65 
 
 		 813 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2195  triple helix repeat-containing collagen  38.76 
 
 		 615 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  39.24 
 
 		 942 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_009038  Sbal_4480  hypothetical protein  38.76 
 
 		 615 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.5 
 
 		 588 aa  48.1  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  34.86 
 
 		 1400 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1459  hypothetical protein  36.84 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.104155  decreased coverage  0.00669659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0274  Hemolysin-type calcium-binding region  32.76 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8979  hypothetical protein  30.07 
 
 		 307 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3124  Collagen triple helix repeat protein  31.46 
 
 		 1580 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  35.06 
 
 		 1145 aa  44.7  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  35 
 
 		 3954 aa  43.9  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  39.76 
 
 		 1279 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  33.7 
 
 		 833 aa  43.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  36.89 
 
 		 686 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  37.5 
 
 		 709 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2610  Collagen triple helix repeat protein  40.48 
 
 		 767 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.965964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0933  hypothetical protein  33.75 
 
 		 586 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0513  hypothetical protein  33.86 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2777  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.3 
 
 		 1372 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.878054  decreased coverage  0.00575711 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 3427 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  42.31 
 
 		 950 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1619  cadherin  42.86 
 
 		 1202 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2165  glycoside hydrolase family protein  40.54 
 
 		 475 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.669505  normal  0.045019 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  38.82 
 
 		 820 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4285  Collagen triple helix repeat protein  40.48 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275713  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0798  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1538 aa  41.6  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4113  Collagen triple helix repeat  35.9 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.366844  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  36.36 
 
 		 833 aa  40.8  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.9 
 
 		 1236 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  35.42 
 
 		 518 aa  40.4  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  34.21 
 
 		 424 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>