Gene Tery_0397 details

Gene Information       Plasmid Coverage information       Fosmid Coverage information       Sequence       

Gene Information

Locus tagTery_0397 
Symbol 
ID4241961 
TypeCDS 
Is gene splicedNo 
Is pseudo geneNo 
Organism nameTrichodesmium erythraeum IMS101 
KingdomBacteria 
Replicon accessionNC_008312 
Strand
Start bp612482 
End bp618103 
Gene Length5622 bp 
Protein Length1873 aa 
Translation table11 
GC content57% 
IMG OID638105722 
Productphage tail Collar 
Protein accessionYP_720336 
Protein GI113474275 
COG category 
COG ID 
TIGRFAM ID 


Plasmid Coverage information

Num covering plasmid clones
Plasmid unclonability p-value
Plasmid hitchhikingNo 
Plasmid clonabilitynormal 
 

Fosmid Coverage information

Num covering fosmid clones14 
Fosmid unclonability p-value
Fosmid HitchhikerNo 
Fosmid clonabilitynormal 
 

Sequence

Gene sequence
TTGAGAAAAG AAATGGAAGA TTTTTTAGAT CAAATTGTTT TTCCAGATAC TTCTTCTTTC 
CAAAGCACTC CTATTAACAC TCTTGTACCT GGAGAATCAA TAACTGTACC AGGTTTTGAG
TTAGTTAATG GGCCCCCAAT TGCTGATCCC TCTCTATTTA TAGAAGTCCC AATTCCAATA
ATACCAGGTT CACCTGGTCC TGTTGGTCCT GCAGGTCCAA GTGGTGCCCC TGGTCCTGTG
GGTCCTATCG GTCCAAGTGG TGCCCCTGGT CCTGTGGGTC CTGTAGGTCC AATAGGTCCT
GTGGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT GGTCTTGCTG GTCCTGTAGG TCCAGCTGGA
GCTGATGGTG TTCCTGGTCT CACTGGTCCT ATTGGTCCTA TTGGTCCAAG TGGTGCCCCT
GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCAACTGGA GCTCCTGGTC CCGCTGGTCC TGTAGGTCCA
GCTGGAGCTG ATGGTGTTCC TGGTCTTGCT GGTCCAGCTG GTCCAATAGG TCCTGTAGGT
CCGGCTGGAG CTGATGGTGT TCCTGGTCTT ACTGGTCCCA TTGGTCCTAT AGGTCCAAGT
GGTGCCCCTG GTCCTGTAGG TCCAATAGGT CCTGTAGGTC CGGCTGGAGC TGATGGTGTT
CCTGGTCTTG CTGGTCCTGT AGGTCCTGTA GGTCCTGTAG GTCCAACTGG AGCTCCTGGT
CCCGCTGGTC CTGTAGGTCC TGTAGGTCCT GTAGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT
GGTCTTGCTG GTCCTGTAGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CAACTGGAGC TCCTGGTCCC
GCTGGTCTTG CTGGTCCAGC TGGTCCAATA GGTCCTGTAG GTCCGGCTGG AGCTGATGGT
GTTCCTGGTC TTACTGGTCC CATTGGTCCT ATAGGTCCAA GTGGAGCCCC TGGTCCCGCT
GGTCCAATAG GTCCTGTAGG TCCAGCTGGA GCTGATGGTG TTCCTGGTCT TGCTGGTCCT
GTAGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCTGTA GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCTATAGGT
CTAACTGGAG CCCCTGGTCC GGCTGGTCCA ATAGGTCCTG TGGGTCCGGC TGGAGCTGAT
GGTGTTCCTG GTCTTACTGG TCCCATTGGT CCTATAGGTC CAAGTGGTGC CCCTGGTCCG
GCTGGTCCAA TAGGTCCTGT GGGTCCGGCT GGAGCTGATG GTGTTCCTGG CCTTGCTGGT
CCTGTAGGTC CTGTAGGTCC TGTAGGTCCG GCTGGAGCTG ATGGTGTTCC TGGTCTTGCT
GGTCCTGTAG GTCCTATAGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CAACTGGAGC TCCTGGTCCC
GCTGGTCCTG TAGGTCCAAT AGGTCCTGTA GGTCCAGCTG GAGCTGATGG TGTTCCTGGT
CTTGCTGGTC CTGTAGGTCC TGTAGGTCCA ACTGGAGCTC CTGGTCCCGC TGGTCCTGTA
GGTCCAATAG GTCCTGTGGG TCCGGCTGGA GCTGATGGTG TTCCTGGTCT TGCTGGTCCT
GCTGGAGCTC CTGGTCCCGC TGGTCCTGTA GGTCCTGTAG GTCCAACTGG AGCTCCTGGT
CCCGCTGGTC CCGCTGGTCC AATAGGTCCT GTGGGTTCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT
GGTCTTACTG GTCCTATTGG TCCTATAGGT CCAAGTGGTG CCCCTGGTCC GGCTGGTCCA
ATAGGTCCTG TAGGTCCGGC TGGAGCTGAT GGTGTTCCTG GTCTTGCTGG TCCTGCTGGA
GCTTCTGGTC CCGCTGGTCC TGTAGGTCCA ATAGGTCCTG TAGGTCCAGC TGGAGCTGAT
GGTGTTCCTG GTCTTGCTGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CAACTGGAGC TCCTGGTCCT
GTAGGTCCAA TAGGTCCTGT GGGTCCGGCT GGAGCTGATG GTGTTCCTGG TCTTGCTGGT
CCTGCTGGAG CTCCTGGTCC CGCTGGTCCA ATAGGTCCTG TGGGTCCGGC TGGAACTGAT
GGTGTTCCTG GTCTTGCTGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CAAGTGGAGC CCCTGGTCCG
GCTGGTCCAA TAGGTCCTGT GGGTCCAACT GGAGCTCCTG GTCCCGCTGG TCCAATAGGT
CCTGTAGGTC CCGCTGGTCC CGCTGGTGGT CCCGCTGGTC CCGCTGGTCC AATAGGTCCT
GTAGGTCCCG CTGGTCCCGC TGGTCCAATA GGTCCTGTGG GTCCGGCTGG ATCTGATGGT
GTTCCTGGTC TTACTGGTCC CATTGGTCCT ATAGGTCCAA GTGGTGCCCC TGGTCCTGTA
GGTCCAATAG GTCCTGTAGG TTCGGCTGGA GCTGATGGTG TTCCTGGTCT TGCTGGTCCT
GCTGGAGCTC CTGGTCCCGC TGGTCCAATA GGTCCTGTAG GTCCGGCTGG AGCTGATGGT
GTTCCTGGTC TTACTGGTCC CATTGGTCCT ATAGGTCCAA GTGGTGCCCC TGGTCCTGTA
GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCAACTGGT GCTCCTGGTC CTGTGGGTCC TGTAGGTCCT
GTAGGTCCTA TAGGTCTAAC TGGAGCCCCT GGTCCGGCTG GTCCAATAGG CCCTGTAGGT
CCAGCTGGAG CTGATGGTGT TCCTGGTCTT GCTGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCTGTA
GGTCCTACTG GAGCTCCTGG TCCCGCTGGT CCGGCTGGTC CAATAGGTCC TGTAGGTCCG
GCTGGAGCTG ATGGTGTTCC TGGTCTTACT GGTCCCATTG GTCCTATAGG TCCAAGTGGT
GCCCCTGGTC CTGTAGGTCC AATAGGTCCT GTGGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT
GGTCTTGCTG GTCCTGTAGG TCCTGTAGGT CCTGTAGGTC CTGTAGGTCC TACTGGAGCT
CCTGGTCCCG CTGGTCCGGC TGGTCCAATA GGTCCTGTAG GTCCAGCTGG AGCTGATGGT
GTTCCTGGTC TTACTGGTCC CATTGGTCCT ATAGGTCCAA GTGGTGCCCC TGGTCCCGCT
GGTCCTGTAG GTCCAATAGG TCCTGTGGGT CCGGCTGGAG CTGATGGTGT TCCTGGTCTT
GCTGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCAACT GGTGCTCCTG GTCCTGTGGG TCCTGTAGGT
CCTGTAGGTC CTATAGGTCT AACTGGAGCC CCTGGTCCGG CTGGTCCAAT AGGTCCTGTA
GGTCCAGCTG GAGCTGATGG TGTTCCTGGT CTTGCTGGTC CTGTAGGTCC TGTAGGTCCT
GTAGGTCCTA CTGGAGCTCC TGGTCCCGCT GGTCCGGCTG GTCCAATAGG TCCTGTAGGT
CCGGCTGGAG CTGATGGTGT TCCTGGTCTT ACTGGTCCCA TTGGTCCTAT AGGTCCAAGT
GGTGCCCCTG GTCCTGTAGG TCCAATAGGT CCTGTGGGTC CGGCTGGAGC TGATGGTGTT
CCTGGTCTTG CTGGTCCTGT AGGTCCTGTA GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCTGTAGGT
CCTACTGGAG CTCCTGGTCC CGCTGGTCCG GCTGGTCCAA TAGGTCCTGT AGGTCCAGCT
GGAGCTGATG GTGTTCCTGG TCTTACTGGT CCCATTGGTC CTATAGGTCC AAGTGGTGCC
CCTGGTCCCG CTGGTCCTGT AGGTCCAATA GGTCCTGTGG GTCCGGCTGG AGCTGATGGT
GTTCCTGGTC TTGCTGGTCC TGTAGGTCCT GTAGGTCCAA CTGGTGCTCC TGGTCCTGTG
GGTCCTGTAG GTCCTGTAGG TCCTATAGGT CTAACTGGAG CCCCTGGTCC GGCTGGTCCA
ATAGGTCCTG TGGGTCCGGC TGGAGCTGAT GGTGTTCCTG GTCTTACTGG TCCCATTGGT
CCTATAGGTC CAAGTGGAGC CCCTGGTCCA GCTGGTCCAA TAGGTCCTGT GGGTCCGGCT
GGAGCTGATG GTGTTCCTGG TCTTGCTGGT CCTGTAGGTC CTGTAGGTCC TGCTGGAGCT
CCTGGTCCAG CTGGTCCAAT AGGTCCTGTA GGTCCCGCTG GAGCTGATGG TGTTCCTGGT
CTTGCTGGTC CTGCTGGAGC TCCTGGTCCC GCTGGTCCTG TAGGTCCGAT AGGTCCTGTG
GGTCCGGCTG GAGCTGATGG TGTTCCTGGT CTTGCTGGTC CTGTAGGTCC AATAGGTCCT
GTAGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTTCTGCT GGAGCTGATG GTGTTCCTGG TCTTGCTGGT
CCTGCTGGTC CTGTAGGTCC AATAGGTCCT GTAGGTCCGG CTGGAGCTGA TGGTGTTCCT
GGTCTTGCTG GTCCTGCTGG TCCAATAGGT CCTGTAGGTC CAACTGGAGC TCCTGGTCCC
ATTGGTCCTA TAGGTCCAAG TGGTGCCCCT GGTCCTGTAG GTCCCATAGG TCCTGTGGGT
CCGGCTGGAG CTGATGGTAT TCCTGGTCTT GCTGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCTGTA
GGTCCAACTG GAGCTCCTGG TCCCATTGGT CCTATAGGTC CAAGTGGTGC CCCTGGTCCT
GTAGGTCCAA TAGGTCCTGT GGGTCCGGCT GGAGCTGATG GTGTTCCTGG TCTTGCTGGT
CCTGCTGGAG CTCCTGGTCC CGCTGGTCCA ATAGGTCCTG TAGGTCCTGC TGGAGCTGAT
GGTGTTCCTG GTCTTACTGG TCCCATTGGT CCTATAGGTC CAAGTGGTGC CCCTGGTCCT
GTAGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCAACT GGAGCTCCTG GTCCTGTAGG TCCAATAGGT
CCTGTGGGTC CGGCTGGAGC TGATGGTGTT CCTGGTCTTG CTGGTCCTGC TGGAGCTCCT
GGTCCCGCTG GTCCAATAGG TCCTGTAGGT CCTGCTGGAG CTCCTGGTCC CGCTGGTCCA
ATAGGTCCTG TAGGTCCTAT AGGCCCAAGT GGTGCCCCTG GTCCTGTAGG TCCTGTAGGT
CCGGCTGGAG CTGATGGTGC TCCTGGTTTT ACTGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCGGCT
GGTCCTATTG GTGCCACTGG TCCTGTAGGT CCGGCTGGAG CTGATGGTGC TCCTGGTTTT
ACTGGTCCTG TAGGTCCTGT AGGTCCGGCT GGTCCTATTG GTGCCACTGG TCCTGTAGGT
CCAACTGGTC CCGTAGGTCC AGCTGGTCCT GTAGGTCCAA CTGGTCCTAT CGGTCCTGGA
ATCCCAACAT TGCCTATCGG GTATATAATT GCTGGAGACA ACTCTCCCAC AGACTTTATA
ACTGGAGAAA TAGTTTTGTG GCCTGGCCTA TCTGTGCCAC CTGGTTTCTT CTCTCTTGAA
GGTCAAGTAT TGCCAATTAC TGGTAATAAT GAGTTGTTTA ATATCGTGGG TAATCAGTAT
GGAGGAGATG GAGTTAACAA CTTCGTACTG CCTAATTTAG TTGGAATTAG TCCAGTAGGT
CGTCAGTTGA ATCAAATAGA AGATTCGGTT ACAGGTCAAC TTTTTGTTGA ATTCCCTAGC
GGTAGCGGTC AATTCATAAA CGCGGACGAT TTTCCAGGAA TAGCTGGAGG AAATACTCCT
TTGGGTCAGA ATTTAAATAA CAACATTGTT GTACCAGCTT AA
 
Protein sequence
MRKEMEDFLD QIVFPDTSSF QSTPINTLVP GESITVPGFE LVNGPPIADP SLFIEVPIPI 
IPGSPGPVGP AGPSGAPGPV GPIGPSGAPG PVGPVGPIGP VGPAGADGVP GLAGPVGPAG
ADGVPGLTGP IGPIGPSGAP GPVGPVGPTG APGPAGPVGP AGADGVPGLA GPAGPIGPVG
PAGADGVPGL TGPIGPIGPS GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPVGPV GPVGPTGAPG
PAGPVGPVGP VGPAGADGVP GLAGPVGPVG PVGPTGAPGP AGLAGPAGPI GPVGPAGADG
VPGLTGPIGP IGPSGAPGPA GPIGPVGPAG ADGVPGLAGP VGPVGPVGPV GPVGPVGPIG
LTGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP AGPIGPVGPA GADGVPGLAG
PVGPVGPVGP AGADGVPGLA GPVGPIGPVG PVGPTGAPGP AGPVGPIGPV GPAGADGVPG
LAGPVGPVGP TGAPGPAGPV GPIGPVGPAG ADGVPGLAGP AGAPGPAGPV GPVGPTGAPG
PAGPAGPIGP VGSAGADGVP GLTGPIGPIG PSGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLAGPAG
ASGPAGPVGP IGPVGPAGAD GVPGLAGPVG PVGPTGAPGP VGPIGPVGPA GADGVPGLAG
PAGAPGPAGP IGPVGPAGTD GVPGLAGPVG PVGPSGAPGP AGPIGPVGPT GAPGPAGPIG
PVGPAGPAGG PAGPAGPIGP VGPAGPAGPI GPVGPAGSDG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPV
GPIGPVGSAG ADGVPGLAGP AGAPGPAGPI GPVGPAGADG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPV
GPVGPVGPTG APGPVGPVGP VGPIGLTGAP GPAGPIGPVG PAGADGVPGL AGPVGPVGPV
GPTGAPGPAG PAGPIGPVGP AGADGVPGLT GPIGPIGPSG APGPVGPIGP VGPAGADGVP
GLAGPVGPVG PVGPVGPTGA PGPAGPAGPI GPVGPAGADG VPGLTGPIGP IGPSGAPGPA
GPVGPIGPVG PAGADGVPGL AGPVGPVGPT GAPGPVGPVG PVGPIGLTGA PGPAGPIGPV
GPAGADGVPG LAGPVGPVGP VGPTGAPGPA GPAGPIGPVG PAGADGVPGL TGPIGPIGPS
GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPVGPV GPVGPVGPVG PTGAPGPAGP AGPIGPVGPA
GADGVPGLTG PIGPIGPSGA PGPAGPVGPI GPVGPAGADG VPGLAGPVGP VGPTGAPGPV
GPVGPVGPIG LTGAPGPAGP IGPVGPAGAD GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP AGPIGPVGPA
GADGVPGLAG PVGPVGPAGA PGPAGPIGPV GPAGADGVPG LAGPAGAPGP AGPVGPIGPV
GPAGADGVPG LAGPVGPIGP VGPVGPVGSA GADGVPGLAG PAGPVGPIGP VGPAGADGVP
GLAGPAGPIG PVGPTGAPGP IGPIGPSGAP GPVGPIGPVG PAGADGIPGL AGPVGPVGPV
GPTGAPGPIG PIGPSGAPGP VGPIGPVGPA GADGVPGLAG PAGAPGPAGP IGPVGPAGAD
GVPGLTGPIG PIGPSGAPGP VGPVGPVGPT GAPGPVGPIG PVGPAGADGV PGLAGPAGAP
GPAGPIGPVG PAGAPGPAGP IGPVGPIGPS GAPGPVGPVG PAGADGAPGF TGPVGPVGPA
GPIGATGPVG PAGADGAPGF TGPVGPVGPA GPIGATGPVG PTGPVGPAGP VGPTGPIGPG
IPTLPIGYII AGDNSPTDFI TGEIVLWPGL SVPPGFFSLE GQVLPITGNN ELFNIVGNQY
GGDGVNNFVL PNLVGISPVG RQLNQIEDSV TGQLFVEFPS GSGQFINADD FPGIAGGNTP
LGQNLNNNIV VPA