33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_05650 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_05650  fibro-slime domain-containing protein  100 
 
 
1104 aa  2263    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1508  adhesion exoprotein  30.6 
 
 
771 aa  61.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1263  Cna B domain protein  30.85 
 
 
863 aa  58.5  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05670  Cna protein B-type domain-containing protein  27.62 
 
 
540 aa  58.2  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.44 
 
 
1004 aa  55.8  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5449  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.04 
 
 
3486 aa  54.7  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5055  collagen adhesion protein  36.04 
 
 
3393 aa  54.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5536  collagen adhesion protein  35.23 
 
 
3392 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00820  putative collagen-binding protein  31.03 
 
 
764 aa  53.9  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0774638  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5480  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  33.06 
 
 
3210 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1536  von Willebrand factor domain-containing protein  37.78 
 
 
920 aa  53.9  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5487  cell wall anchor domain-containing protein  34.09 
 
 
3242 aa  53.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0364  fibro-slime family protein  30.48 
 
 
570 aa  52  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.227511 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0774  von Willebrand factor type A/Cna B-type domain-containing protein  35.24 
 
 
928 aa  52.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0109767  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1408  cell wall surface anchor family protein  30 
 
 
901 aa  52.4  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0771  cell wall surface anchor family protein  27.91 
 
 
549 aa  52.4  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5206  collagen adhesion protein  31.53 
 
 
1102 aa  52.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5039  collagen adhesion protein  27.52 
 
 
3333 aa  52.4  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5207  collagen adhesion protein, C-terminal  39.13 
 
 
882 aa  52  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1188  fibro-slime family protein  37.5 
 
 
271 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5471  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  30.05 
 
 
3190 aa  50.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00194019 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05710  hypothetical protein  38.46 
 
 
1514 aa  49.7  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.583259  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0961  cell wall anchor domain-containing protein  34.43 
 
 
1508 aa  48.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0645  cell wall surface anchor family protein  34.04 
 
 
554 aa  47.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0149  outer membrane protein  31.4 
 
 
1804 aa  47.8  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24340  putative collagen-binding protein  28.03 
 
 
845 aa  47  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0924  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.08 
 
 
1328 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1579  Cna B domain protein  34.48 
 
 
4909 aa  47  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0110  Cna B domain protein  38.64 
 
 
1066 aa  47  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4751  fibro-slime family protein  50 
 
 
256 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0796  Cna B domain protein  35.29 
 
 
1256 aa  46.2  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05660  hypothetical protein  37.5 
 
 
248 aa  45.8  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.643233  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4406  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  37.08 
 
 
1112 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>