12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6555 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6555  lipopolysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 413 aa  812    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1568  lipopolysaccharide biosynthesis  54.3 
 
 		 255 aa  194  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.454248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  63.89 
 
 		 991 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  49.23 
 
 		 897 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2449 aa  60.1  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0752  hypothetical protein  26.46 
 
 		 284 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0250821  hitchhiker  0.0000974771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8489  hypothetical protein  28.93 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.833858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4471  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 279 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  34.21 
 
 		 2397 aa  46.2  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4884  tRNA (adenine-N(1)-)-methyltransferase  41.94 
 
 		 358 aa  44.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.340373  normal  0.205134 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  34.57 
 
 		 1888 aa  43.9  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  37.84 
 
 		 367 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>