34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1516 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  692    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  52.06 
 
 		 347 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  49.08 
 
 		 312 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  51.04 
 
 		 350 aa  200  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  54.35 
 
 		 330 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  58.93 
 
 		 385 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  61.11 
 
 		 285 aa  156  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  50.93 
 
 		 415 aa  104  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  52 
 
 		 410 aa  103  5e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  58.54 
 
 		 425 aa  101  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  49.44 
 
 		 435 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  49.44 
 
 		 433 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  54.22 
 
 		 490 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  43.07 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  46.51 
 
 		 402 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  47.19 
 
 		 462 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  47.56 
 
 		 564 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  49.33 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  55.38 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  37.65 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  58.33 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  48.78 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  69.64 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  28.89 
 
 		 2449 aa  61.2  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.79 
 
 		 330 aa  55.8  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  29.83 
 
 		 3472 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  29.83 
 
 		 3471 aa  54.3  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  28.12 
 
 		 3521 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  52.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  72.92 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  72.92 
 
 		 351 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82710  Inositol-1,4,5-triphosphate 5-phosphatase  30 
 
 		 1118 aa  49.7  0.00007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.124532 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  23.56 
 
 		 3409 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6555  lipopolysaccharide biosynthesis protein  37.84 
 
 		 413 aa  42.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>