22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5539 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  100 
 
 
402 aa  697    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  94 
 
 
462 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  45.28 
 
 
435 aa  159  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  43.54 
 
 
433 aa  155  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  45.53 
 
 
454 aa  146  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  63.64 
 
 
414 aa  122  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  44.09 
 
 
360 aa  96.3  8e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  46.92 
 
 
450 aa  92  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  44.55 
 
 
425 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  41.73 
 
 
285 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  47.67 
 
 
312 aa  83.2  0.000000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  43.02 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  43.02 
 
 
410 aa  82.4  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  42.22 
 
 
490 aa  79.7  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  44.19 
 
 
347 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  44.19 
 
 
350 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  42.35 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  45.35 
 
 
330 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  48.98 
 
 
173 aa  65.1  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  52.05 
 
 
367 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  50.85 
 
 
273 aa  51.2  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  38.82 
 
 
330 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>