24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5156 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  100 
 
 
462 aa  807    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  93.07 
 
 
402 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  43.48 
 
 
433 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  43 
 
 
435 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  44.36 
 
 
454 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  60.61 
 
 
414 aa  133  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  43.51 
 
 
360 aa  96.7  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  39.66 
 
 
425 aa  94.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  40.82 
 
 
415 aa  91.7  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  59.38 
 
 
450 aa  89.4  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  37.5 
 
 
285 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  39.8 
 
 
410 aa  89  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  40.2 
 
 
490 aa  80.1  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  46.94 
 
 
385 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  42.86 
 
 
347 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  40.82 
 
 
564 aa  76.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  43.96 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  45.56 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  52.05 
 
 
367 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  46.94 
 
 
173 aa  62.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  37.78 
 
 
124 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
330 aa  48.5  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  50.85 
 
 
273 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  41.56 
 
 
351 aa  45.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>