27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_4412 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  100 
 
 		 385 aa  681    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  58.06 
 
 		 347 aa  259  8e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  53.63 
 
 		 367 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  54.5 
 
 		 330 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  68.42 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  57.29 
 
 		 312 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  58.52 
 
 		 285 aa  158  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  40.57 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  40.57 
 
 		 410 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  53.49 
 
 		 425 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  47.37 
 
 		 435 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  47.37 
 
 		 433 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  46.94 
 
 		 462 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  47.31 
 
 		 402 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  43.68 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  54.88 
 
 		 490 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  47.56 
 
 		 564 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  48 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  38.2 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  46.67 
 
 		 450 aa  79.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  41.98 
 
 		 173 aa  72  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  51.25 
 
 		 143 aa  67.4  0.0000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  75.51 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  59.04 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  75 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  76 
 
 		 355 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  37.08 
 
 		 124 aa  49.3  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>