28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1131 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  100 
 
 
285 aa  545  1e-154  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  72.84 
 
 
312 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  46.05 
 
 
350 aa  195  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  44.13 
 
 
367 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  46 
 
 
330 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  54.45 
 
 
385 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  51.02 
 
 
415 aa  105  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  33.45 
 
 
435 aa  103  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  57.83 
 
 
425 aa  103  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  54.35 
 
 
410 aa  102  7e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  47.25 
 
 
402 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  47.25 
 
 
462 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  43.81 
 
 
433 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  45 
 
 
414 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  53.66 
 
 
490 aa  88.6  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  52.44 
 
 
564 aa  85.1  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  46.53 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  60.38 
 
 
450 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  41.18 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  44.74 
 
 
173 aa  69.7  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  50 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  78.43 
 
 
273 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  60.26 
 
 
355 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  56.25 
 
 
330 aa  56.6  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  55.29 
 
 
347 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  70.91 
 
 
351 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  40.51 
 
 
124 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.67 
 
 
2449 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>