32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1692 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  75.5 
 
 		 330 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  53.59 
 
 		 367 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  59.95 
 
 		 385 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  53.68 
 
 		 350 aa  218  8.999999999999998e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  50.14 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  44.76 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  50 
 
 		 415 aa  102  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  50 
 
 		 410 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  51.61 
 
 		 425 aa  99  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  32.7 
 
 		 435 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  42.57 
 
 		 433 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  43.96 
 
 		 402 aa  90.1  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  43.82 
 
 		 462 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  53.57 
 
 		 490 aa  87.8  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  42.31 
 
 		 414 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  49.4 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  45.24 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  62.07 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  38.58 
 
 		 143 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  36.78 
 
 		 360 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  52.54 
 
 		 173 aa  72.4  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.25 
 
 		 2449 aa  67  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  82.22 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  68.33 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  54.32 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  77.55 
 
 		 351 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  39.51 
 
 		 124 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.25 
 
 		 3521 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.14 
 
 		 3409 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  26.63 
 
 		 3472 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  26.63 
 
 		 3471 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>