31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2639 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  100 
 
 
454 aa  848    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  79.3 
 
 
435 aa  434  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  78.66 
 
 
433 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  45.21 
 
 
414 aa  164  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  68.09 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  62.04 
 
 
462 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  39.06 
 
 
360 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  68.63 
 
 
450 aa  85.5  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  36.57 
 
 
415 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  36.84 
 
 
410 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  39.8 
 
 
564 aa  80.9  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  41.48 
 
 
312 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  34.14 
 
 
285 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  37.37 
 
 
490 aa  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  44.57 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  45.26 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  43 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  45 
 
 
330 aa  70.5  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  32.65 
 
 
2449 aa  65.1  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  48.15 
 
 
173 aa  62.8  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  48.68 
 
 
367 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  47.14 
 
 
143 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  26.19 
 
 
3521 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5067  cell surface protein  26.34 
 
 
3409 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4640  cell surface anchor  28.03 
 
 
3471 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4659  cell surface protein  28.03 
 
 
3472 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
330 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  50 
 
 
273 aa  49.3  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  48.84 
 
 
124 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  55.1 
 
 
355 aa  44.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  50 
 
 
351 aa  44.3  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>