29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2829 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  51.95 
 
 		 425 aa  77.8  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  48.39 
 
 		 410 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  48.39 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  40.16 
 
 		 347 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  48.84 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  45.12 
 
 		 564 aa  68.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  40.22 
 
 		 490 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  53.95 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  52.63 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  50 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  47.06 
 
 		 435 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  55.13 
 
 		 385 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  45 
 
 		 360 aa  61.2  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  47.56 
 
 		 433 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  51.9 
 
 		 350 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  39.53 
 
 		 414 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  50 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  44.71 
 
 		 402 aa  57  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  45.24 
 
 		 454 aa  57  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  33.98 
 
 		 462 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  56.36 
 
 		 450 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  57.38 
 
 		 367 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1365  fliO protein  44 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.28 
 
 		 330 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1939  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.229105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  38.46 
 
 		 144 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  60.87 
 
 		 273 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3462  hypothetical protein  36 
 
 		 124 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.77174  normal  0.0205832 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>