28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2465 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2465  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  944    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.753425  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1526  putative CheA signal transduction histidine kinase  65.59 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.268978  normal  0.80072 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2123  hypothetical protein  58.02 
 
 		 425 aa  103  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1003  hypothetical protein  58.02 
 
 		 415 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1962  hypothetical protein  76.34 
 
 		 355 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173944  normal  0.121037 
 
 
-
 
NC_004310  BR1038  hypothetical protein  58.02 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2174  putative FHA domain containing protein  76.34 
 
 		 351 aa  99.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00685953  normal  0.0299055 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4636  hypothetical protein  51.81 
 
 		 564 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.301683  normal  0.113577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2832  hypothetical protein  41.3 
 
 		 435 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882909  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2236  hypothetical protein  39.18 
 
 		 414 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3528  hypothetical protein  63.27 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0397838 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0854  hypothetical protein  65.96 
 
 		 173 aa  73.2  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.033138  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1985  hypothetical protein  40.66 
 
 		 360 aa  72.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.100261 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1741  hypothetical protein  75.86 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.108522  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2639  hypothetical protein  55.1 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5539  hypothetical protein  43.37 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229127  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2609  hypothetical protein  39.78 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.256064  normal  0.144177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5156  hypothetical protein  42.7 
 
 		 462 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1131  hypothetical protein  53.66 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.545921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5498  hypothetical protein  57.69 
 
 		 350 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0881144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1692  hypothetical protein  55.13 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.65025  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1391  hypothetical protein  50 
 
 		 312 aa  64.3  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4412  putative exported protein of unknown function  55.7 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1516  hypothetical protein  57.35 
 
 		 367 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0503822  normal  0.882647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3778  hypothetical protein  53.85 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0222237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2829  hypothetical protein  38.89 
 
 		 143 aa  59.7  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2569  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.720897  normal  0.146928 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  25.91 
 
 		 2449 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>