18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_22510 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_22510  hypothetical protein  100 
 
 
608 aa  1214    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.818778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21010  hypothetical protein  46.12 
 
 
370 aa  234  5e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08560  hypothetical protein  37.16 
 
 
262 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000399194 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00430  hypothetical protein  31.77 
 
 
301 aa  140  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.381463 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0254  hypothetical protein  34.34 
 
 
423 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.158302  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  35.94 
 
 
484 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  37.09 
 
 
926 aa  56.6  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  32.9 
 
 
489 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  50 
 
 
268 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1119  G5 domain protein  24.29 
 
 
1859 aa  51.2  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.983019  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  30.72 
 
 
630 aa  50.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  22.58 
 
 
2449 aa  48.1  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  30.63 
 
 
444 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3298  flagellar hook-length control protein  25.31 
 
 
602 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5038  conserved repeat domain protein  36.97 
 
 
3521 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1710  hypothetical protein  29.79 
 
 
522 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  32.69 
 
 
2313 aa  43.9  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23491  hypothetical protein  38.18 
 
 
480 aa  43.5  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.425384 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>