14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_02094 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  100 
 
 
434 aa  890    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  67.74 
 
 
465 aa  627  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  43.69 
 
 
462 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  43.86 
 
 
462 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  37.09 
 
 
483 aa  226  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  36.63 
 
 
488 aa  224  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  34.51 
 
 
643 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.85 
 
 
638 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.63 
 
 
534 aa  187  4e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.28 
 
 
693 aa  182  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  29.83 
 
 
667 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  29.39 
 
 
868 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  30.15 
 
 
823 aa  91.3  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  25.2 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>