15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0919 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  96.1 
 
 
462 aa  867    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  100 
 
 
462 aa  943    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  47.38 
 
 
465 aa  328  9e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  43.86 
 
 
434 aa  306  6e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  34.55 
 
 
483 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  34.15 
 
 
488 aa  192  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  33.5 
 
 
643 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.35 
 
 
693 aa  169  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.85 
 
 
638 aa  148  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.54 
 
 
534 aa  127  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  30.56 
 
 
667 aa  114  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  27.64 
 
 
868 aa  89.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  28.43 
 
 
823 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  28.12 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  30.27 
 
 
940 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>