15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0494 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3699  endoproteinase Arg-C  96.65 
 
 
483 aa  926    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35914  normal  0.89588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0494  endoproteinase Arg-C  100 
 
 
488 aa  979    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.072982  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  46.37 
 
 
643 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4239  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  42.89 
 
 
534 aa  327  3e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.256718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.67 
 
 
638 aa  311  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  42.32 
 
 
693 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02094  endoproteinase Arg-C  36.63 
 
 
434 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.246327  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02206  endoproteinase Arg-C  34.35 
 
 
465 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09900  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  34.3 
 
 
462 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00818916  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0919  Pvds-regulated endoprotease, lysyl class  34.3 
 
 
462 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1951  hypothetical protein  28.27 
 
 
667 aa  126  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0489  lysyl endopeptidase  28.95 
 
 
868 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000398143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  28.07 
 
 
823 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0553  extracellular protease, putative  27.67 
 
 
940 aa  75.9  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3637  hypothetical protein  30.52 
 
 
472 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000381817 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>