25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0897 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  100 
 
 
483 aa  976    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0392  cell wall surface anchor family protein  46.58 
 
 
521 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.786642  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  55.3 
 
 
377 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  52.32 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  50.68 
 
 
324 aa  142  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  44.87 
 
 
176 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  49.61 
 
 
232 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  41.61 
 
 
290 aa  106  9e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  48.82 
 
 
303 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  42.34 
 
 
207 aa  102  1e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  47.41 
 
 
152 aa  96.7  9e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  43.85 
 
 
256 aa  94.7  3e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.94 
 
 
693 aa  80.1  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  44.34 
 
 
144 aa  79  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  35.62 
 
 
815 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.75 
 
 
606 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  32.81 
 
 
595 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  31.28 
 
 
808 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  70.5  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 
427 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  30.11 
 
 
643 aa  67.4  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  30.46 
 
 
514 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.37 
 
 
638 aa  55.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1336  cell wall surface anchor family protein  52.83 
 
 
151 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  28.1 
 
 
633 aa  43.5  0.008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>