55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0518 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  100 
 
 
377 aa  770    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  55.3 
 
 
483 aa  155  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  54.48 
 
 
416 aa  155  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  54.74 
 
 
324 aa  151  2e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  49.04 
 
 
232 aa  143  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  49.68 
 
 
303 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  47.65 
 
 
176 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  49.3 
 
 
207 aa  129  9.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  45.75 
 
 
290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  50 
 
 
152 aa  112  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  42.94 
 
 
256 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  43.65 
 
 
815 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  43.48 
 
 
144 aa  90.9  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  36.42 
 
 
427 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  39.73 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5718  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.09 
 
 
693 aa  85.1  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.295381 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  36.81 
 
 
643 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  39.2 
 
 
595 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.41 
 
 
606 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.72 
 
 
638 aa  80.1  0.00000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  35.71 
 
 
808 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  32.52 
 
 
514 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2530  hypothetical protein  27.67 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358537  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  37.06 
 
 
633 aa  63.2  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0637  hypothetical protein  32.87 
 
 
239 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7127  hypothetical protein  35 
 
 
403 aa  60.8  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0488  hypothetical protein  29.27 
 
 
252 aa  60.5  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0630  hypothetical protein  28.31 
 
 
238 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0543  hypothetical protein  30.18 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0574  hypothetical protein  28.31 
 
 
248 aa  59.3  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0485  hypothetical protein  30.28 
 
 
250 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0705  YvpB  32.87 
 
 
216 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0487  hypothetical protein  30.28 
 
 
250 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4727  hypothetical protein  28.05 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.903215  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0494  hypothetical protein  28.07 
 
 
271 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0615  hypothetical protein  33.88 
 
 
236 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0615  hypothetical protein  33.88 
 
 
236 aa  57.8  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0612  hypothetical protein  27.44 
 
 
251 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0759  hypothetical protein  34.51 
 
 
236 aa  56.2  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00058188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0620  hypothetical protein  34.51 
 
 
237 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0671  hypothetical protein  34.51 
 
 
236 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0705  hypothetical protein  34.51 
 
 
236 aa  56.2  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0774  hypothetical protein  34.51 
 
 
236 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.829999  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0126  hypothetical protein  32.79 
 
 
258 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2190  hypothetical protein  31.97 
 
 
258 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000017111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0833  hypothetical protein  33.63 
 
 
236 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0739  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4598  hypothetical protein  31.86 
 
 
236 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000475668  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0593  hypothetical protein  29.31 
 
 
236 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1679  hypothetical protein  28.32 
 
 
240 aa  48.1  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0338933  hitchhiker  0.00693626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2482  hypothetical protein  28.83 
 
 
288 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30.34 
 
 
914 aa  46.6  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2511  hypothetical protein  26.67 
 
 
218 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.206392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2462  hypothetical protein  26.67 
 
 
218 aa  46.6  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0111157  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  34.34 
 
 
939 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>