22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1614 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1614  surface antigen  100 
 
 
144 aa  296  6e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000315849  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1630  surface antigen  66.94 
 
 
290 aa  176  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000382803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0110  surface antigen  61.72 
 
 
152 aa  160  6e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1708  surface antigen  61.07 
 
 
256 aa  152  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.63868  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0651  surface antigen  58.33 
 
 
232 aa  149  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1705  surface antigen  56.25 
 
 
303 aa  139  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000827022  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0223  surface antigen  62.24 
 
 
207 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0518  hypothetical protein  43.48 
 
 
377 aa  90.9  5e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0009  hypothetical protein  46.53 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.115503  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1519  hypothetical protein  47.83 
 
 
176 aa  82  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00366032  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0897  hypothetical protein  46.23 
 
 
483 aa  78.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  42.42 
 
 
416 aa  76.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  33.61 
 
 
427 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  37.97 
 
 
815 aa  51.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3770  Integrin alpha beta-propellor repeat protein  30.77 
 
 
595 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.707249 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1183  hypothetical protein  34.86 
 
 
633 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0802936  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4069  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 
638 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2215  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 
606 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158252 
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5615  hypothetical protein  32.65 
 
 
269 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  33.33 
 
 
514 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4238  hypothetical protein  39.13 
 
 
643 aa  43.5  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.311548 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3593  5'-Nucleotidase domain protein  31.96 
 
 
808 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0380941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>