74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0494 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  45.52 
 
 		 1202 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  49.23 
 
 		 448 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  39.87 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  39.47 
 
 		 1042 aa  105  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  39.55 
 
 		 938 aa  105  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  41.94 
 
 		 669 aa  102  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  40 
 
 		 560 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  43.1 
 
 		 713 aa  102  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  39.68 
 
 		 1001 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  38.31 
 
 		 996 aa  98.2  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  40.44 
 
 		 769 aa  94.4  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  34.1 
 
 		 403 aa  94  8e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  37.78 
 
 		 960 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  37.82 
 
 		 1279 aa  86.7  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  35.77 
 
 		 971 aa  86.7  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  36.22 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  29.19 
 
 		 675 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  36.7 
 
 		 1361 aa  82.4  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.33 
 
 		 581 aa  81.6  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  38.18 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  31.82 
 
 		 658 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  30.77 
 
 		 815 aa  75.1  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  41.67 
 
 		 685 aa  70.9  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  33.87 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  40.43 
 
 		 679 aa  68.2  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  32.85 
 
 		 514 aa  67.8  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  32.21 
 
 		 379 aa  67.4  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  39.78 
 
 		 517 aa  64.7  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  33.62 
 
 		 819 aa  56.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  30.77 
 
 		 329 aa  54.3  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  34.21 
 
 		 331 aa  52.4  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 441 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.28 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  26.17 
 
 		 434 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  26.19 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.61 
 
 		 443 aa  45.8  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  25.51 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  33.72 
 
 		 169 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  32.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  24.26 
 
 		 324 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  32.45 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  29.68 
 
 		 1263 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  26.27 
 
 		 451 aa  45.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25 
 
 		 449 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  25.51 
 
 		 430 aa  44.7  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  31.03 
 
 		 444 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  31.19 
 
 		 428 aa  44.7  0.0007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  32.04 
 
 		 424 aa  44.3  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.42 
 
 		 449 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.19 
 
 		 572 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  21.28 
 
 		 771 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  29.63 
 
 		 414 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  28.85 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 423 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1181  hypothetical protein  30.43 
 
 		 442 aa  42.4  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.726983  normal  0.0574597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 433 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  23.33 
 
 		 450 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  28.85 
 
 		 423 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  32.1 
 
 		 175 aa  42  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.62 
 
 		 446 aa  41.6  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  30.84 
 
 		 437 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  30.84 
 
 		 440 aa  41.6  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 445 aa  41.6  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  32.74 
 
 		 403 aa  41.6  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.08 
 
 		 172 aa  41.2  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.18 
 
 		 446 aa  41.2  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 462 aa  40.8  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  23.21 
 
 		 463 aa  40.8  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 423 aa  40.8  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  24.53 
 
 		 450 aa  40.4  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1569  WD40 domain-containing protein  26.5 
 
 		 449 aa  40.8  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00119024 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>