56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1578 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 		 448 aa  908    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  42.42 
 
 		 728 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  39.54 
 
 		 675 aa  211  2e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  38.44 
 
 		 669 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  40.21 
 
 		 560 aa  195  1e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  38.87 
 
 		 938 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  38.31 
 
 		 1202 aa  187  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  36.28 
 
 		 1001 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  39.39 
 
 		 713 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  38.19 
 
 		 1042 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  32.65 
 
 		 769 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  36.27 
 
 		 960 aa  166  8e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  35.61 
 
 		 374 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  45.31 
 
 		 581 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  31.83 
 
 		 403 aa  150  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  32.63 
 
 		 996 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  32.63 
 
 		 1361 aa  144  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.65 
 
 		 971 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  32.51 
 
 		 379 aa  137  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  42.25 
 
 		 658 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.41 
 
 		 1279 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  49.23 
 
 		 171 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  30.74 
 
 		 815 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  29.11 
 
 		 685 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  34.15 
 
 		 195 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.86 
 
 		 679 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  28.48 
 
 		 331 aa  94  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  27.86 
 
 		 819 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  29.19 
 
 		 329 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  38.66 
 
 		 126 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  26.46 
 
 		 1263 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  26.1 
 
 		 771 aa  79  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3324  hypothetical protein  29.55 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0125921  normal  0.0119157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1859  hypothetical protein  29.19 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.956553 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  36.56 
 
 		 517 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  25.09 
 
 		 514 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.05 
 
 		 572 aa  53.9  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.4 
 
 		 567 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  30.71 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  28.93 
 
 		 169 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.4 
 
 		 442 aa  47.4  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1181  hypothetical protein  24.11 
 
 		 442 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.726983  normal  0.0574597 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.23 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  24.23 
 
 		 422 aa  46.6  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.64 
 
 		 340 aa  45.8  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.08 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  24.46 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.79 
 
 		 172 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  29.81 
 
 		 437 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  29.81 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  32.71 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  31.36 
 
 		 160 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.36 
 
 		 160 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.78 
 
 		 446 aa  43.1  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  23.91 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0145  hypothetical protein  26.88 
 
 		 961 aa  43.1  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>