42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3787 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_0577  hypothetical protein  83.89 
 
 
800 aa  1363    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3913  hypothetical protein  98.75 
 
 
802 aa  1608    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3701  hypothetical protein  64.96 
 
 
801 aa  1088    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0628  hypothetical protein  66.75 
 
 
801 aa  1096    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.5767  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3787  hypothetical protein  100 
 
 
802 aa  1627    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3299  hypothetical protein  85.54 
 
 
800 aa  1414    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0460  hypothetical protein  67.52 
 
 
799 aa  1092    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0538  hypothetical protein  97.83 
 
 
737 aa  1469    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4321  hypothetical protein  66.38 
 
 
801 aa  1101    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3128  hypothetical protein  63.34 
 
 
794 aa  1030    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.556775  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3501  hypothetical protein  65.22 
 
 
798 aa  1046    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3452  hypothetical protein  84.4 
 
 
800 aa  1363    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0578  hypothetical protein  84.4 
 
 
800 aa  1365    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1102  hypothetical protein  43.84 
 
 
800 aa  649    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0578  hypothetical protein  82.92 
 
 
800 aa  1366    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3730  hypothetical protein  98.38 
 
 
802 aa  1603    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01042  predicted extracellular metal-dependent peptidase  42.65 
 
 
815 aa  584  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4490  hypothetical protein  42.78 
 
 
843 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.174167  normal  0.217423 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0271  hypothetical protein  41.35 
 
 
845 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0296  hypothetical protein  35.42 
 
 
837 aa  454  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34400  Matrixin  36.58 
 
 
850 aa  409  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.255467  normal  0.892097 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4438  hypothetical protein  33.33 
 
 
807 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2083  hypothetical protein  29.88 
 
 
885 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326889  normal  0.523075 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2846  hypothetical protein  29.47 
 
 
942 aa  164  7e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.10395  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2398  hypothetical protein  27.83 
 
 
863 aa  152  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4851  hypothetical protein  25.03 
 
 
1010 aa  148  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00405142 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11328  hypothetical protein  29.78 
 
 
825 aa  141  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2967  hypothetical protein  26.01 
 
 
952 aa  132  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0557  hypothetical protein  25.29 
 
 
827 aa  120  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4670  hypothetical protein  24.04 
 
 
865 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.90015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0727  hypothetical protein  25.21 
 
 
862 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3925  conserved hypothetical protein, membrane or secreted  23.61 
 
 
859 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6153  hypothetical protein  24.64 
 
 
812 aa  100  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.444969  normal  0.508364 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4495  hypothetical protein  24.34 
 
 
846 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0732922 
 
 
-
 
NC_002950  PG2029  hypothetical protein  25.92 
 
 
859 aa  97.1  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00240601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3800  hypothetical protein  28.72 
 
 
812 aa  95.5  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.343956  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1995  hypothetical protein  25.1 
 
 
890 aa  93.2  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141711  hitchhiker  0.000402055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1424  hypothetical protein  23.56 
 
 
853 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.669741 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05500  hypothetical protein  23.47 
 
 
834 aa  91.3  6e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0359775  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5142  hypothetical protein  24.29 
 
 
837 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000152526  hitchhiker  0.00373987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5115  hypothetical protein  26.6 
 
 
846 aa  84.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.317159  normal  0.084756 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0404  hypothetical protein  30.09 
 
 
1152 aa  46.2  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>