96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3709 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3709  Deoxyribonuclease I  100 
 
 		 232 aa  486  1e-136  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000796266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3907  Deoxyribonuclease I  96.12 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000139034  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0504  Deoxyribonuclease I  78.02 
 
 		 233 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000136601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0547  Deoxyribonuclease I  78.35 
 
 		 232 aa  384  1e-106  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000480912  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3349  deoxyribonuclease I  74.46 
 
 		 235 aa  374  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000315843  decreased coverage  0.00212113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3332  endonuclease I  80.66 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172543  normal  0.387366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4024  deoxyribonuclease I  76.72 
 
 		 231 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000163525  decreased coverage  0.000370071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3340  endonuclease I  80.66 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00611255  normal  0.202483 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3267  endonuclease I  80.19 
 
 		 235 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0010351  normal  0.0484419 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3256  endonuclease I  80.19 
 
 		 235 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000148246  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3436  endonuclease I  80.66 
 
 		 235 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00127424  hitchhiker  0.00168464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3087  endonuclease I  74.46 
 
 		 235 aa  364  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00686191  hitchhiker  0.0000298257 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4248  endonuclease I  74.46 
 
 		 235 aa  363  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.260828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0841  deoxyribonuclease I  74.14 
 
 		 235 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.0000000000239428  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3345  endonuclease I  74.14 
 
 		 235 aa  363  1e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0839  endonuclease I  74.14 
 
 		 235 aa  363  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3377  endonuclease I  74.03 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02738  hypothetical protein  74.03 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.252778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3288  endonuclease I  74.03 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.961762  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3103  endonuclease I  74.03 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02775  DNA-specific endonuclease I  74.03 
 
 		 235 aa  361  5.0000000000000005e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.153052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0769  deoxyribonuclease I  73.59 
 
 		 235 aa  360  7.0000000000000005e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000516595  unclonable  0.0000000197257 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0750  Deoxyribonuclease I  73.59 
 
 		 235 aa  360  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00967955  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002464  endonuclease I precursor  64.84 
 
 		 231 aa  296  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0550  endonuclease I precursor  60.43 
 
 		 237 aa  296  2e-79  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03571  endonuclease I  67.46 
 
 		 231 aa  293  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0022  extracellular deoxyribonuclease  61.21 
 
 		 231 aa  291  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3223  deoxyribonuclease I  59.09 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000396495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4133  deoxyribonuclease I  59.28 
 
 		 251 aa  268  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0867821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0833  endonuclease I  56.96 
 
 		 258 aa  268  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3331  deoxyribonuclease I  57.02 
 
 		 257 aa  263  1e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000877394  normal  0.801712 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3971  deoxyribonuclease I  58.65 
 
 		 251 aa  263  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0691  deoxyribonuclease I  56.58 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000438774  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3443  endonuclease I  56.58 
 
 		 257 aa  263  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000111641  hitchhiker  0.00909149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0842  deoxyribonuclease I  53.85 
 
 		 258 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000267909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0810  deoxyribonuclease I  63.64 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000171872  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0576  deoxyribonuclease I  54.74 
 
 		 242 aa  260  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000105466  normal  0.211294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3525  deoxyribonuclease I  63.1 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000100295  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0835  Deoxyribonuclease I  63.1 
 
 		 258 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000225063  hitchhiker  0.0000104704 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2973  deoxyribonuclease I  55.61 
 
 		 269 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.576725  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3160  deoxyribonuclease I  58.49 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000648022  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0544  deoxyribonuclease I  55.31 
 
 		 254 aa  249  3e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135905  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3757  deoxyribonuclease I  50.43 
 
 		 323 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163237  normal  0.488138 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2569  deoxyribonuclease I  53.67 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0107726  normal  0.160045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2383  deoxyribonuclease I  53.21 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.178356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3375  deoxyribonuclease I  53.21 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02310  Deoxyribonuclease I  52.81 
 
 		 268 aa  232  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1915  deoxyribonuclease I  54.26 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.468697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1350  deoxyribonuclease I  51.74 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40130  deoxyribonuclease I  54.23 
 
 		 231 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0550387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2148  deoxyribonuclease I  50.88 
 
 		 233 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000104352  normal  0.178715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2364  endonuclease I  54.5 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.170845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3242  deoxyribonuclease I  52.44 
 
 		 230 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.187326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3521  deoxyribonuclease I  52.02 
 
 		 230 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.643247  normal  0.271071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2451  deoxyribonuclease I  51.34 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2493  DNA-specific endonuclease I  48.9 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28570  DNA-specific endonuclease I  48.9 
 
 		 237 aa  208  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000174219 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4374  deoxyribonuclease I  52.48 
 
 		 288 aa  205  6e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000699204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0624  deoxyribonuclease I  52.48 
 
 		 241 aa  203  2e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00856225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2065  deoxyribonuclease I  43.7 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.014094  normal  0.0314213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1309  deoxyribonuclease I  44.02 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.122078  normal  0.128017 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2835  deoxyribonuclease I  43.16 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0256  extracellular deoxyribonuclease  37.67 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4577  deoxyribonuclease I  38.06 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.5492500000000006e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4415  deoxyribonuclease I  38.06 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.69182e-28  decreased coverage  0.000909905 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4599  deoxyribonuclease I  38.06 
 
 		 243 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  1.26401e-21  normal  0.918023 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1458  Deoxyribonuclease I  39.84 
 
 		 249 aa  149  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.118773  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2580  deoxyribonuclease I  36.63 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.316828 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0601  deoxyribonuclease I  36.51 
 
 		 250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2748  endonuclease I  29 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5532  Endonuclease I  29.94 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0708603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4067  endonuclease I  30.71 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1948  endonuclease I  30.77 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04827  ribonuclease  30.56 
 
 		 539 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001088  endonuclease I  28.87 
 
 		 538 aa  59.3  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  27.54 
 
 		 614 aa  58.9  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  32.82 
 
 		 542 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4721  endonuclease I  29.41 
 
 		 617 aa  56.6  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4761  Endonuclease I  28.93 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0283458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10308  putative secreted ribonuclease  31.65 
 
 		 365 aa  53.5  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1033  endonuclease I  31.11 
 
 		 1503 aa  52.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.8795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3396  endonuclease I  29.32 
 
 		 539 aa  52.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0097  endonuclease I  28.41 
 
 		 558 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4257  endonuclease I  28.41 
 
 		 558 aa  52.4  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3049  endonuclease I  31.54 
 
 		 275 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00672798  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1907  ribonuclease  31.54 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3323  ribonuclease  31.54 
 
 		 275 aa  52  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.934207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3124  ribonuclease  31.54 
 
 		 275 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0290634  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3370  ribonuclease  31.54 
 
 		 275 aa  51.6  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2634  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  28.46 
 
 		 1310 aa  50.1  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3021  endonuclease I  27.37 
 
 		 553 aa  48.9  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00455766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26920  endonuclease I  29.46 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1877  Endonuclease I  31.54 
 
 		 388 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  27.59 
 
 		 1346 aa  45.4  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1896  Endonuclease I  28.32 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1505  Endonuclease I  27.54 
 
 		 311 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.12259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>