143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5252 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  100 
 
 
356 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2537  peptidase M4, thermolysin  59.3 
 
 
348 aa  400  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3601  peptidase M4 thermolysin  54.89 
 
 
341 aa  393  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.238334  normal  0.290182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  54.78 
 
 
347 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1125  peptidase M4 thermolysin  55.26 
 
 
349 aa  390  1e-107  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00938174  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  54.2 
 
 
347 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0599  peptidase M4 thermolysin  54.44 
 
 
354 aa  378  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.410805 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2731  peptidase M4 thermolysin  52.31 
 
 
357 aa  369  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00336587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7042  peptidase M4 thermolysin  57.6 
 
 
351 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2947  peptidase M4, thermolysin  52.35 
 
 
360 aa  363  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2629  peptidase M4, thermolysin  54.18 
 
 
347 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.235261  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  52.29 
 
 
375 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  53.33 
 
 
353 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30670  Zinc metalloprotease (elastase)  60.9 
 
 
547 aa  352  7e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3233  peptidase M4 thermolysin  51.31 
 
 
342 aa  348  1e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.029325  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2362  peptidase M4 thermolysin  53.06 
 
 
350 aa  344  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000736237 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4056  peptidase M4, thermolysin  54.55 
 
 
430 aa  322  8e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1188  peptidase M4 thermolysin  47.7 
 
 
403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3041  bacillolysin  47.04 
 
 
356 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0173986  normal  0.0722993 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3176  thermolysin metallopeptidase, putative  47.63 
 
 
356 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03436  neutral protease A  61.73 
 
 
207 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  35.45 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  39.24 
 
 
565 aa  182  6e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  40.28 
 
 
566 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  36.68 
 
 
546 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  37.58 
 
 
566 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  37.58 
 
 
566 aa  176  6e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  40.96 
 
 
556 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  39.37 
 
 
566 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  38.82 
 
 
556 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  39.76 
 
 
566 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  39.58 
 
 
566 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  39.76 
 
 
566 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  39.22 
 
 
556 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  38.98 
 
 
566 aa  169  7e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  38.58 
 
 
566 aa  169  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  38.98 
 
 
566 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  38.67 
 
 
556 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3622  peptidase M4 thermolysin  36.12 
 
 
478 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5183  neutral protease B, bacillolysin  35.36 
 
 
591 aa  162  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00705702  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0100  neutral protease, N-terminal region  39.41 
 
 
274 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0090986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  34.98 
 
 
591 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  35.36 
 
 
554 aa  159  6e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  35.36 
 
 
549 aa  159  6e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  35.36 
 
 
554 aa  159  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  34.98 
 
 
591 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  34.98 
 
 
556 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4867  peptidase M4 thermolysin  34.98 
 
 
549 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5282  neutral protease B  34.87 
 
 
547 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.346731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4907  neutral protease B  34.87 
 
 
552 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  38.34 
 
 
507 aa  153  4e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  37.7 
 
 
509 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  37.7 
 
 
509 aa  152  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  35.32 
 
 
532 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0437  peptidase M4 thermolysin  38.14 
 
 
1017 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00224619  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  32.94 
 
 
1031 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  29.79 
 
 
1154 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  32.17 
 
 
777 aa  103  4e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  33.33 
 
 
759 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  34.34 
 
 
775 aa  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  35.35 
 
 
984 aa  99.4  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  28.06 
 
 
527 aa  99.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  31.78 
 
 
778 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  31.78 
 
 
778 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  31.78 
 
 
778 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  31.78 
 
 
778 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7164  ZmpA peptidase  29.97 
 
 
565 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  36.81 
 
 
791 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0380  neutral protease  28.97 
 
 
568 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000306257  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  30.47 
 
 
780 aa  94.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07565  thermolysin  34.31 
 
 
1251 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8540  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  37.23 
 
 
889 aa  93.6  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.810503  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  26.32 
 
 
924 aa  94  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3170  neutral protease (bacillolysin)  28.57 
 
 
565 aa  92.4  9e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000070765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3408  bacillolysin  28.57 
 
 
565 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  31.66 
 
 
485 aa  92.4  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3091  neutral protease (bacillolysin)  28.57 
 
 
565 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000299935  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  29.52 
 
 
558 aa  91.3  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  31.34 
 
 
498 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  29.49 
 
 
499 aa  91.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  31.2 
 
 
221 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3189  neutral protease  28.57 
 
 
565 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000741792  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  29.52 
 
 
558 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3442  neutral protease  28.57 
 
 
565 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  31.31 
 
 
498 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  29.56 
 
 
543 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  29.56 
 
 
543 aa  90.1  5e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  30.36 
 
 
774 aa  90.5  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2738  metalloendopeptidase  28.69 
 
 
567 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.89181e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2464  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.69 
 
 
567 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000399034  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2499  extracellular neutral metalloprotease, bacillolysin  28.69 
 
 
567 aa  89  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000144667  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0816  thermolysin metallopeptidase  28.92 
 
 
565 aa  88.6  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273503  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  29.8 
 
 
500 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3392  bacillolysin  28.17 
 
 
565 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000112359  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2787  metalloendopeptidase  28.69 
 
 
567 aa  89  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000221035  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2543  neutral protease  28.69 
 
 
567 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000016311  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2551  metalloendopeptidase  28.32 
 
 
567 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000846614  decreased coverage  0.0000000000277026 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2730  neutral protease  28.69 
 
 
567 aa  88.6  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000476564  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  29.63 
 
 
500 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  35.4 
 
 
609 aa  88.2  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>