33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1336 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  100 
 
 		 419 aa  853    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  36.14 
 
 		 340 aa  228  1e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  35.91 
 
 		 1880 aa  176  7e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.57 
 
 		 831 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  36.51 
 
 		 727 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  39.34 
 
 		 285 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  35.5 
 
 		 258 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  33.06 
 
 		 251 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.94 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 266 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  33.93 
 
 		 252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  35.75 
 
 		 218 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  35.38 
 
 		 627 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  33.92 
 
 		 230 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  37.38 
 
 		 233 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  39.87 
 
 		 165 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  37.02 
 
 		 571 aa  112  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  30.06 
 
 		 396 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  32.86 
 
 		 239 aa  103  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  36.28 
 
 		 238 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  28.26 
 
 		 552 aa  93.2  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  34.56 
 
 		 230 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  37.91 
 
 		 161 aa  89.4  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  29.36 
 
 		 491 aa  89.4  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  27.57 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  25.68 
 
 		 865 aa  72.8  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  26.25 
 
 		 552 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  28.57 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  25.1 
 
 		 552 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  24.62 
 
 		 551 aa  65.1  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.16 
 
 		 277 aa  63.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  26.78 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  24.51 
 
 		 546 aa  57.4  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>