33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1356 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  100 
 
 
552 aa  1121    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  40.61 
 
 
491 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  52.94 
 
 
280 aa  253  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 
266 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  33.94 
 
 
245 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  31.87 
 
 
251 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  30.93 
 
 
831 aa  110  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  33.04 
 
 
1880 aa  108  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  33.33 
 
 
266 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  28.69 
 
 
340 aa  101  4e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  30.36 
 
 
230 aa  99.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  29.69 
 
 
571 aa  98.2  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  30.12 
 
 
252 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  28.26 
 
 
419 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  28.97 
 
 
727 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  36.54 
 
 
161 aa  88.6  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  31.72 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  27.5 
 
 
218 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  28.52 
 
 
285 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  31.46 
 
 
233 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  31.67 
 
 
865 aa  78.6  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  32.63 
 
 
546 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  31.44 
 
 
552 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  27.97 
 
 
258 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  31.61 
 
 
552 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  27.08 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.91 
 
 
277 aa  73.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  30.3 
 
 
551 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  26.61 
 
 
239 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  27.34 
 
 
627 aa  65.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  29.27 
 
 
165 aa  63.9  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  29.48 
 
 
238 aa  63.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  26.36 
 
 
250 aa  51.2  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>