35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03283 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03283  rhamnogalacturonan acetylesterase  100 
 
 
161 aa  327  6e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.826167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  48.2 
 
 
831 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4664  lipolytic protein G-D-S-L family  42.36 
 
 
285 aa  115  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.106654  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  43.48 
 
 
727 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  39.86 
 
 
1880 aa  107  8.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4246  GDSL family lipase  44.72 
 
 
218 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1242  lipolytic protein G-D-S-L family  36.36 
 
 
251 aa  100  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0146465  normal  0.0264869 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2735  GDSL family lipase  45.07 
 
 
239 aa  99.4  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.886563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2325  lipolytic protein G-D-S-L family  42.86 
 
 
340 aa  97.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3094  GntR family transcriptional regulator  38.93 
 
 
266 aa  94  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000466752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1522  lipolytic protein G-D-S-L family  37.41 
 
 
252 aa  92.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.652703  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3820  Pectinesterase  41.43 
 
 
627 aa  92  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4445  lipolytic protein G-D-S-L family  37.96 
 
 
230 aa  90.5  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.185378  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1336  GDSL family lipase  37.91 
 
 
419 aa  89.4  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.341885 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  36.49 
 
 
865 aa  89.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1356  GDSL family lipase  36.54 
 
 
552 aa  88.6  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1156  lipolytic protein G-D-S-L family  34.93 
 
 
266 aa  87  9e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.866129  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0769  lipolytic protein G-D-S-L family  35.14 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1231  Lysophospholipase L1 and related esterase-like protein  27.75 
 
 
280 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0882392 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3046  pectin acetylesterase  33.77 
 
 
552 aa  75.1  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  34.25 
 
 
552 aa  73.9  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29260  lysophospholipase L1-like esterase  36.55 
 
 
230 aa  73.2  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3313  GDSL family lipase  39.39 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3372  lipolytic protein G-D-S-L family  34.71 
 
 
396 aa  72.4  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2765  lipolytic protein G-D-S-L family  35.62 
 
 
546 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.198603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4226  GDSL family lipase  30.72 
 
 
491 aa  72  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4273  pectinesterase  37.6 
 
 
571 aa  67.8  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1088  pectin acetylesterase  34.25 
 
 
551 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2824  putative rhamnogalacturonan acetylesterase  50 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02528  Putative uncharacterized proteinRhamnogalacturonan acetylesterase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5BAA2]  36.3 
 
 
245 aa  65.1  0.0000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3111  lipolytic protein G-D-S-L family  38.84 
 
 
238 aa  63.5  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4022  GDSL family lipase  32.09 
 
 
277 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.604582 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02834  esterase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17250)  27.52 
 
 
250 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.417764  normal  0.0230725 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  30.28 
 
 
222 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  26.45 
 
 
213 aa  40.4  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>